双方就支付拖欠工资达成的协议，确实可以作为证据提起劳动仲裁。以下从多个角度为你详细分析：

1. 协议的法律效力：

   • 双方就支付拖欠工资达成的协议，本质上是一种民事合同。只要该协议是双方真实意思的表示，且不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗，那么该协议就具有法律效力。
   • 在劳动仲裁中，这份协议可以作为证明用人单位拖欠工资以及双方就支付事宜达成一致的直接证据。

2. 协议作为证据的具体应用：

   • 证明拖欠事实：协议中通常会明确用人单位拖欠工资的具体金额、时间等关键信息，这些信息是劳动仲裁中认定拖欠事实的重要依据。
   • 证明双方协商：协议还体现了双方就支付拖欠工资事宜进行了协商，并达成了共识。这有助于仲裁机构了解案件背景，判断用人单位是否存在恶意拖欠等情形。

3. 可能遇到的法律问题及建议：

   • 协议的真实性：如果用人单位对协议的真实性提出异议，如否认协议上的签名或盖章等，那么可能需要通过笔迹鉴定、公章鉴定等方式来确认协议的真实性。
   • 协议的履行情况：如果协议签订后，用人单位仍未按照协议约定支付拖欠工资，那么劳动者在提起劳动仲裁时，除了提交协议作为证据外，还需要提供用人单位未履行的相关证据，如银行转账记录、工资条等。
   • 建议：在签订协议时，劳动者应确保协议内容明确、具体，包括拖欠工资的金额、支付时间、支付方式等。同时，最好要求用人单位在协议上加盖公章或由法定代表人签字确认，以增加协议的法律效力。如果可能的话，还可以将协议进行公证或由第三方见证，以进一步增强其证明力。

4. 劳动仲裁的流程：

   • 提交仲裁申请：劳动者需要向当地劳动仲裁机构提交仲裁申请，并附上相关证据材料，包括双方就支付拖欠工资达成的协议。
   • 仲裁受理：劳动仲裁机构在收到申请后，会进行审查并决定是否受理。如果受理，会通知双方当事人并安排开庭时间。
   • 开庭审理：在开庭时，双方当事人需要就案件事实进行陈述和辩论，并提交相关证据。仲裁机构会根据双方提交的证据和陈述进行裁决。
   • 裁决执行：如果仲裁机构裁决用人单位支付拖欠工资，而用人单位拒不履行裁决，劳动者可以向人民法院申请强制执行。

综上所述，双方就支付拖欠工资达成的协议可以作为证据提起劳动仲裁。在签订协议时，劳动者应确保协议内容明确、具体，并尽可能增加其法律效力。如果遇到法律问题或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。