结论：在文职工作中因和领导意见不合，部队领导让您辞职，您有权拒绝并可以采取一系列措施来维护自己的合法权益。
详细分析：
辞职的自愿性原则：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，员工辞职应当是自愿的，除非存在法定情形（如严重违反用人单位规章制度、给用人单位造成重大损害等），否则用人单位不得强迫员工辞职。
- 在您的情况下，仅仅因为与领导意见不合，并不构成用人单位可以强迫您辞职的合法理由。
应对策略：
- 拒绝辞职：首先，您可以明确拒绝领导的辞职要求，表明您希望继续履行劳动合同。
- 沟通协商：尝试与领导进行沟通，了解他们提出辞职要求的具体原因，并寻求双方都能接受的解决方案。如果沟通无果，您可以考虑向更高层级的领导或人事部门反映情况。
- 保留证据：在沟通过程中，注意保留相关证据，如聊天记录、邮件、录音等，以备不时之需。
- 寻求法律援助：如果用人单位坚持强迫您辞职，您可以向当地的劳动监察部门投诉，或者寻求专业律师的法律援助，通过法律途径维护自己的合法权益。
可能的法律后果：
- 如果用人单位违法解除劳动合同，根据《中华人民共和国劳动合同法》的规定，您有权要求用人单位支付经济补偿金，甚至可能要求恢复劳动关系。
- 经济补偿金的计算方式通常是根据您在用人单位的工作年限和月工资来确定的。具体计算公式为：经济补偿金 = 工作年限 × 月工资（月工资是指劳动者在劳动合同解除或者终止前十二个月的平均工资）。
特殊情况考虑：
- 如果您所在的部队文职岗位有特殊的规章制度或管理要求，您需要仔细了解这些规定，并评估它们是否适用于您的情况。但即便如此，任何规章制度都不得违反法律法规的强制性规定。
建议：
- 在处理此类问题时，保持冷静和理性至关重要。不要因为情绪激动而做出冲动的决定。
- 及时咨询专业律师，了解自己的法律权益和可能的法律后果，以便做出明智的决策。
- 如果您决定通过法律途径维护自己的权益，请确保在诉讼时效内提起诉讼或申请仲裁。
如果您有任何进一步的疑问或需要具体的法律帮助，请随时向我咨询。