结论：顾客起诉商家赔偿100元交通费和住宿费是否合理，需根据具体情况判断，但通常情况下，仅因商家不让拍营业执照这一行为，顾客直接要求赔偿此类费用可能缺乏直接法律依据，合理性存疑。
分析：
商家不让拍营业执照的合法性：
- 根据相关法律法规，营业执照是商家的合法经营凭证，但并未明确规定顾客有权随意拍摄。商家的经营场所属于其私人或经营空间，商家有权决定是否允许顾客拍摄其营业执照或其他内部文件。因此，商家不让拍营业执照，从法律上讲，并不直接构成违法行为。
顾客要求赔偿的法律依据：
- 顾客要求商家赔偿交通费和住宿费，通常需要基于商家存在过错或违约行为，且该行为与顾客的损失之间存在直接因果关系。在本案例中，商家不让拍营业执照的行为，并不直接导致顾客产生交通费和住宿费。除非顾客能证明，因商家不让拍营业执照，导致其不得不前往其他地点或采取其他措施，从而产生了额外费用，且这些费用是合理且必要的。
赔偿的合理性判断：
- 即便顾客能证明存在上述因果关系，赔偿的金额也需要合理。100元的交通费和住宿费，如果确实是因商家行为导致的合理且必要支出，那么从原则上讲，顾客有权要求赔偿。但通常情况下，这类费用与商家不让拍营业执照的行为之间的直接关联性较弱，因此赔偿的合理性可能受到质疑。
可能的法律后果：
- 如果顾客坚持起诉，法院将根据双方提供的证据和法律规定进行裁决。如果法院认为商家行为不构成违法或违约，或者顾客无法证明其损失与商家行为之间的直接因果关系，那么顾客的诉讼请求可能会被驳回。
建议：
- 对于顾客而言，如果认为商家行为不当，可以先尝试与商家协商解决，或者向相关消费者保护机构投诉，而不是直接起诉要求赔偿。
- 对于商家而言，虽然有权决定是否允许顾客拍摄营业执照，但也应考虑到顾客的合理需求，尽量提供便利或解释原因，以避免不必要的纠纷。
进一步思考：
- 在实际生活中，类似的小纠纷往往可以通过沟通协商解决，而无需诉诸法律。法律是维护社会秩序和公平正义的最后一道防线，但并非解决所有问题的最佳方式。
- 如果顾客确实认为自己的权益受到了侵害，且无法通过协商解决，那么在起诉前应充分收集证据，明确自己的诉讼请求和法律依据，以提高胜诉的可能性。
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