关于“保密协议说工资包含保密费是否有效”的问题，结论前置如下：

1. 若合同中有明确约定且合法合理，则有效：保密协议中明确约定工资包含保密费，且该约定是双方真实意思的表示，不违反法律法规的强制性规定，那么这种约定是有效的。
2. 若合同未明确约定或约定违法，则可能无效：如果保密协议中未明确约定工资包含保密费，或者该约定违反了法律法规的强制性规定，损害了劳动者的合法权益，那么这种约定可能是无效的。

详细分析如下：

一、合同约定的有效性

• 双方真实意思表示：保密协议中关于工资包含保密费的约定，必须是用人单位和劳动者双方真实、自愿的意思表示。如果存在欺诈、胁迫等不正当手段影响协议的签订，那么该约定可能是无效的。
• 内容合法合理：约定内容不得违反法律法规的强制性规定，也不得损害劳动者的合法权益。例如，协议不能要求劳动者承担不合理的保密义务或违约责任，也不能将保密费设定为过低的金额，以至于无法合理补偿劳动者因承担保密义务而可能遭受的损失。

二、保密费与工资的关系

• 相互独立或包含关系：保密费与工资既可能相互独立，也可能在特定情况下被约定为包含关系。这主要取决于用人单位与劳动者之间的具体约定。如果双方明确约定工资中包含保密费，且该约定合法合理，那么这种约定是有效的。
• 行业惯例与地区性要求：在某些特定行业中，将保密费纳入工资已成为一种普遍做法。同时，不同地区可能存在不同的法律规定或政策要求，因此在实际操作中需要关注并遵守当地的相关法律法规和政策规定。例如，部分地区可能要求保密费应单独支付，不得包含在工资中。

三、法律后果与建议

• 法律后果：如果保密协议中关于工资包含保密费的约定有效，那么用人单位应按照约定支付包含保密费的工资。如果用人单位未支付或支付不足，劳动者有权要求用人单位补足差额或承担违约责任。如果约定无效，那么用人单位应单独支付保密费（如果双方有此约定且合法合理），或者劳动者无需承担保密义务（如果保密义务的设定违法或不合理）。
• 建议：为了避免潜在的纠纷和风险，用人单位和劳动者在签订保密协议时，应明确双方在保密费和工资方面的权利义务关系。具体来说，可以在协议中明确约定保密费的数额、支付方式、支付时间等关键条款，并确保这些条款合法合理、符合当地法律法规和政策要求。同时，双方也可以考虑咨询专业律师的意见，以确保协议的合法性和有效性。

举例说明：

假设某公司与员工签订了一份保密协议，其中明确约定员工的工资中包含一定金额的保密费。如果该约定是双方真实意思的表示，且不违反法律法规的强制性规定，那么这种约定是有效的。公司应按照约定支付包含保密费的工资给员工。如果公司未支付或支付不足，员工有权要求公司补足差额或承担违约责任。

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