结论：签协议时老板说某些条款没用但保留了录音，该录音在特定条件下是有效的，可以作为证据使用，但录音的效力及能否直接证明条款无效需结合具体情况分析。
分析说明：
录音作为证据的有效性：
- 根据《中华人民共和国民事诉讼法》及相关司法解释，录音作为视听资料，属于法定证据种类之一。只要录音内容真实、合法，且与案件事实有关联，就可以作为证据使用。
- 在您的情况下，如果录音清晰、完整，能够准确反映老板对条款效力的陈述，且录音过程未侵犯他人合法权益（如隐私权），那么该录音是有效的。
录音能否直接证明条款无效：
- 录音虽然可以记录老板对条款效力的陈述，但条款的效力并非仅由一方当事人的陈述决定。条款的效力取决于其是否违反法律、行政法规的强制性规定，是否违背公序良俗，以及是否双方真实意思表示等。
- 如果录音中老板明确表示某些条款无效，但这并不意味着这些条款在法律上就真的无效。需要进一步分析这些条款的具体内容，以及是否符合法律规定的无效情形。
录音在合同纠纷中的作用：
- 在合同纠纷中，录音可以作为辅助证据，用于证明双方当事人的真实意思表示、合同履行情况等。
- 如果录音内容与合同文本、其他证据相互印证，形成完整的证据链，那么录音的证明力将更强。
特殊场景：
- 如果老板在录音中明确表示某些条款是为了规避法律而设立的，或者这些条款明显违反了法律、行政法规的强制性规定，那么这些条款很可能被认定为无效。此时，录音将成为证明条款无效的重要证据。
- 如果录音内容模糊、不完整，或者存在其他争议点（如录音的真实性、合法性等），那么录音的证明力将受到质疑。在这种情况下，可能需要结合其他证据来综合判断条款的效力。
行动建议：
- 保存好录音证据：确保录音的完整性、清晰性，并妥善保存原始载体（如手机、录音笔等）。
- 收集其他相关证据：如合同文本、往来邮件、短信、聊天记录等，以形成完整的证据链。
- 咨询专业律师：如果您对录音的效力或条款的效力有疑问，建议直接向我咨询。我可以根据您的具体情况，提供专业的法律意见和诉讼策略。
后续思考依据：
在处理合同纠纷时，证据的收集和整理至关重要。录音作为一种视听资料证据，其效力及证明力需结合具体情况分析。因此，在保留录音的同时，还应积极收集其他相关证据，以形成有力的证据链来支持自己的主张。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。