教师流产手术请假通常不应扣工资。以下从法律依据和实际操作中的注意事项两个角度进行详细分析：
法律依据
《女职工劳动保护特别规定》第七条：
- 女职工怀孕未满4个月流产的，享受15天产假；
- 怀孕满4个月流产的，享受42天产假。
- 产假期间，工资照发。这意味着，无论流产发生在怀孕的哪个阶段，女职工都有权享受相应的产假，并且在这期间，用人单位应当支付工资。
《中华人民共和国劳动法》第五十一条：
- 劳动者在法定休假日和婚丧假期间以及依法参加社会活动期间，用人单位应当依法支付工资。虽然此条未直接提及流产假，但流产假作为女职工的法定权益之一，其性质与上述假期类似，应视为带薪假期。
地方政策：
- 部分地区（如上海）明确规定，女职工流产时享受的产假工资由生育保险基金或单位支付，具体标准根据当地政策执行。这进一步确认了流产假期间工资应照发的原则。
实际操作中的注意事项
及时通知学校并提交证明：
- 教师应在流产后及时向学校提交医疗机构的诊断证明或其他相关材料，以便学校核实并安排休假事宜。这是确保教师能够顺利享受流产假并获得工资支付的重要步骤。
了解学校具体规定：
- 不同学校可能有不同的内部管理制度和流程，教师应提前了解并遵守相关规定。例如，有些学校可能要求教师提前申请流产假，或者需要特定的审批流程。了解这些规定有助于教师更好地维护自己的权益。
保留相关证据：
- 如遇到工资被扣除的情况，教师应保留好相关证据（如医疗证明、请假申请、工资单等），以便通过法律途径维护自己的合法权益。如果学校违反了相关法律法规，教师有权向劳动监察部门投诉或提起劳动仲裁。
总结与建议：
教师流产手术请假期间，工资应照发，这是由相关法律法规明确规定的。在实际操作中，教师应及时通知学校并提交相关证明，了解学校的具体规定，并保留好相关证据以备不时之需。如果遇到工资被扣除的情况，教师应积极维护自己的合法权益，必要时可以寻求法律援助。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。