针对您与朋友合作做工程但未明确分成比例，现在有利润了该如何处理的问题，以下是我的分析和建议：

1. 协商确定分成比例：

   • 核心原则：首先，我建议你们双方坐下来，基于合作期间的贡献、投入、风险承担等因素，友好协商确定一个双方都能接受的分成比例。这是最直接且成本最低的解决方式。
   • 操作建议：在协商过程中，可以回顾合作期间的各项投入，包括资金、技术、人力等，以及各自承担的风险和责任，以此作为分成比例的参考依据。同时，也要考虑未来的合作可能性，尽量达成一个公平且可持续的分成方案。

2. 参考行业惯例或类似案例：

   • 行业惯例：如果协商无果，你们可以参考所在行业的惯例或类似合作案例中的分成比例。这有助于为你们提供一个相对客观的参考标准。
   • 案例研究：通过研究类似案例，了解法院在处理类似纠纷时是如何认定分成比例的，这可以为你们提供一定的法律预期。但请注意，每个案例都有其独特性，不能直接照搬。

3. 寻求第三方调解或仲裁：

   • 调解：如果双方仍然无法达成一致，可以考虑寻求第三方调解机构的帮助。调解机构可以协助你们沟通、协商，并尝试找到一个双方都能接受的解决方案。
   • 仲裁：如果调解无果，你们还可以选择仲裁方式解决纠纷。仲裁是一种相对快速、保密且具有法律效力的纠纷解决方式。但请注意，仲裁结果通常具有终局性，一旦作出，双方均需遵守。

4. 法律途径解决：

   • 起诉：如果以上方式均无法解决问题，你们还可以考虑通过法律途径解决纠纷。即向法院提起诉讼，要求法院根据合作事实、法律规定以及公平原则等，判决一个合理的分成比例。
   • 法律风险：但请注意，诉讼过程可能较为漫长且成本较高，同时诉讼结果也存在不确定性。因此，在决定起诉前，请务必充分评估法律风险和经济成本。

额外建议：

• 完善合作协议：为了避免未来再次出现类似纠纷，我建议你们在未来的合作中签订一份详细的合作协议，明确各自的权利、义务以及分成比例等关键条款。
• 保留相关证据：在处理当前纠纷的过程中，请务必保留好所有与合作相关的证据，如合作协议、投入记录、沟通记录等。这些证据将在协商、调解、仲裁或诉讼过程中发挥重要作用。

最后，我希望你们能够通过友好协商解决当前纠纷，维护好彼此之间的合作关系。如果协商无果或遇到其他法律问题，请随时向我咨询，我会根据你们的实际情况提供更具体的法律建议。