法院认定还款顺序时，会结合转账备注、合同约定、交易习惯及双方举证情况综合判断，但合同明确约定“先还利息”的条款具有优先效力，转账备注“还材料款”通常不足以直接推翻合同约定，除非借款人能证明双方存在其他合意或债权人同意变更还款顺序。具体分析如下：

1. 合同约定优先：法律对还款顺序的默认规则与约定优先原则

根据《民法典》第六百七十四条，借款人应按约定支付利息；若未约定利息支付期限，借款期间不满1年的应在返还时一并支付，满1年的每满1年支付一次。若合同明确约定“先还利息”，则该条款对双方具有约束力，借款人需优先清偿利息，剩余部分才视为偿还本金。
转账备注“还材料款”仅能反映借款人的单方意思表示，若债权人未明确认可该备注（如未在备注中确认“同意变更还款顺序”），则备注内容不构成对合同条款的修改。法院通常会认为，借款人作为付款方，有义务在转账时明确区分利息和本金，若未区分，则优先按合同约定处理。

2. 转账备注的效力：需结合其他证据综合判断

转账备注属于“单方行为”，其法律效力取决于债权人是否接受。若债权人主张“按合同约定先还利息”，借款人需提供证据证明双方存在其他合意（如聊天记录、补充协议等），否则法院可能认定：

• 借款人未履行优先还息义务：即使备注“还材料款”，法院也可能将部分款项认定为利息（如按合同约定利率计算应还利息金额），剩余部分冲抵本金；
  
• 债权人未明确反对备注内容：若债权人收款后未提出异议，借款人可能主张“双方已变更还款顺序”，但需承担举证责任（如证明债权人实际接受该变更）。

3. 实务中的关键点：举证责任与交易习惯

• 举证责任：借款人主张“转账备注已变更还款顺序”的，需证明债权人同意该变更（如书面确认、口头录音等）；若无法证明，法院通常按合同约定处理。
  
• 交易习惯：若双方长期交易中均以“转账备注”作为还款性质依据，且债权人未提出异议，法院可能参考交易习惯认定还款顺序，但需以“不违反合同明确约定”为前提。

4. 建议：如何避免争议？

• 借款人：转账时明确备注“还利息+本金金额”（如“还2023年1月利息5000元+本金10000元”），并保留与债权人的沟通记录；
  
• 债权人：收款后及时核对还款性质，若发现借款人未按合同约定还息，应立即提出异议并留存证据（如书面通知、聊天记录）。

总结：合同约定“先还利息”是核心依据，转账备注“还材料款”需结合其他证据才能推翻合同约定。若发生争议，法院会优先保护债权人的合同权利，除非借款人能证明双方已达成新的合意。如有具体案件细节，可进一步向我咨询。