结论：按揭贷款买受人将该房产卖给第三人并交付入住后，能否对抗申请执行人的查封执行，需根据具体情况判断，主要涉及是否完成过户登记、买受人是否享有足以排除强制执行的民事权益等因素。以下从不同角度进行分析：
一、已完成过户登记的情况
法律背景：
- 根据《民法典》及相关司法解释，不动产物权的设立、变更、转让和消灭，经依法登记，发生效力；未经登记，不发生效力，但是法律另有规定的除外。
- 若房产已从按揭贷款买受人名下过户至第三人名下，则第三人已成为房产的合法所有权人。
法律后果：
- 在此情况下，第三人作为房产的合法所有权人，其权益受法律保护，申请执行人无权对已过户至第三人名下的房产进行查封执行。
二、未完成过户登记的情况
法律背景：
- 若房产尚未完成过户登记，则第三人虽已支付房款并入住，但并未取得房产的合法所有权。
- 此时，房产仍登记在按揭贷款买受人名下，从法律外观上看，买受人仍是房产的所有权人。
能否对抗查封执行：
- 一般情况：在未完成过户登记的情况下，第三人通常难以直接对抗申请执行人的查封执行。因为申请执行人基于房产登记在买受人名下的事实，有权申请对房产进行查封执行。
- 特殊情况：若第三人能够证明其已支付全部房款、实际占有使用房产，且对未办理过户登记没有过错（如因买受人原因导致无法过户），则根据《最高人民法院关于人民法院办理执行异议和复议案件若干问题的规定》等相关司法解释，第三人可能享有足以排除强制执行的民事权益，从而对抗申请执行人的查封执行。但这种情况需要第三人提供充分证据证明其权益的合法性和优先性。
三、具体建议
对于第三人：
- 在购买按揭贷款房产时，应谨慎审查房产的权属状况，确保房产无抵押、查封等权利限制。
- 签订购房合同时，应明确约定过户时间、违约责任等条款，以保障自身权益。
- 在支付房款后，应及时督促买受人办理过户登记手续，避免产生不必要的法律风险。
- 若因买受人原因导致无法过户，应及时收集证据，准备通过法律途径维护自身权益。
对于申请执行人：
- 在申请查封执行房产前，应仔细核查房产的权属状况，确保查封执行的合法性。
- 若发现房产已出售给第三人但未过户，应评估第三人的权益状况，判断是否可能构成足以排除强制执行的民事权益。
- 在执行过程中，应尊重第三人的合法权益，避免侵犯其合法权益导致执行程序受阻或产生其他法律后果。
总结：按揭贷款买受人将房产卖给第三人并交付入住后，能否对抗申请执行人的查封执行，需根据房产是否完成过户登记、第三人是否享有足以排除强制执行的民事权益等因素综合判断。如有具体法律问题或需要进一步法律帮助，请直接向我咨询。