在公司发匿名邮件这一行为，根据现行的《邮件快件实名收寄管理办法》及相关规定，是不被允许的。以下是对这一问题的详细解答：

首先，我们需要明确的是，根据《邮件快件实名收寄管理办法》的规定，邮政企业、快递企业以及经营邮政通信业务的企业（以下统称寄递企业）在收寄邮件、快件时，必须要求寄件人出示有效身份证件，对寄件人身份进行查验，并登记身份信息。这是为了保障邮件、快件的安全，防止不法分子利用匿名邮件进行违法活动。

其次，寄件人出示的有效身份证件包括居民身份证、临时居民身份证、军人身份证件、武装警察身份证件、港澳台居民居住证、港澳居民来往内地通行证、台湾居民来往大陆通行证、外国公民护照以及国家规定的其他有效身份证件。这些规定确保了寄件人身份的真实性和可追溯性。

再者，如果寄件人拒绝出示有效身份证件或者拒绝寄递企业登记身份信息，寄递企业是有权拒绝收寄邮件、快件的。同样，如果寄递企业在收寄过程中发现寄件人在寄递详情单上填写的姓名与出示的有效身份证件不一致，也有权拒绝收寄。

此外，寄递企业还需要使用符合国家有关要求的实名收寄信息系统，并与国家实名收寄信息监管平台联网，及时收集、录入、报送实名收寄信息。这是为了确保信息的真实、准确、完整，便于监管部门进行管理和监督。

最后，如果寄递企业违反了实名收寄的相关规定，将会受到邮政管理部门的处罚。这包括责令改正、罚款以及对直接负责的主管人员和其他直接责任人员的处罚。

综上所述，根据现行的规定和制度，在公司发匿名邮件是不被允许的。为了保障邮件、快件的安全和合规性，建议寄件人在寄送邮件、快件时出示有效身份证件，并配合寄递企业进行身份查验和信息登记。如果您对公司流程制度有任何疑问或建议，也可以向公司相关部门或管理层进行咨询和反馈。