面对实体合法但程序不合法的房屋已拆迁情况，被拆迁人应采取以下措施来维护自己的合法权益：

1. 收集并固定证据

   • 文件材料：尽管房屋已被拆迁，但应尽可能收集拆迁公告、补偿安置方案、评估报告等相关文件，这些文件是了解拆迁情况和判断程序合法性的基础。
   • 现场记录：如果拆迁过程中有拍照或录像记录，这些将成为证明拆迁行为是否合法的重要证据。特别是记录拆迁行为、房屋状况及周边环境变化，以证明是否存在程序违法行为。
   • 沟通证据：保存与拆迁方的所有沟通记录，如短信、邮件、函件等，这些记录可以证明双方协商过程和拆迁方的不合理要求，有助于揭示程序不合法的环节。

2. 分析程序违法点

   • 仔细审查拆迁过程中的各个环节，包括拆迁决定的作出、补偿安置方案的制定、评估报告的出具、拆迁公告的发布等，找出其中可能存在的程序违法点。例如，是否未依法进行听证、是否未给予被拆迁人充分的陈述和申辩机会、是否未按照法定程序进行评估等。

3. 尝试与拆迁方协商

   • 在掌握充分证据和了解法律规定后，可以尝试与拆迁方进行理性沟通，提出拆迁程序中的违法问题及合理补偿要求。通过协商，有可能达成双方都能接受的补偿协议，从而避免进一步的法律纠纷。

4. 申请听证

   • 根据《国有土地上房屋征收与补偿条例》等相关法律法规，被拆迁人有权在拆迁过程中申请听证。如果认为拆迁程序存在违法点，可以向相关部门申请听证，表达意见和诉求，争取在听证过程中纠正程序违法行为。

5. 行政投诉举报

   • 向城乡建设部门、国土资源部门等相关行政部门投诉举报拆迁中的违法行为。这些部门有权对拆迁行为进行调查和处理，如果确认存在程序违法行为，可以责令拆迁方改正或给予行政处罚。

6. 行政复议

   • 如果认为拆迁决定或补偿决定存在程序违法行为，可以在得知决定之日起60日内，向作出决定的机关或其上级机关提起行政复议。行政复议机关将对拆迁决定的合法性进行审查，并作出复议决定。如果复议决定确认拆迁决定违法，被拆迁人可以据此要求拆迁方承担相应的法律责任。

7. 行政诉讼

   • 如果行政复议未能解决问题，或者认为行政复议决定不合法，可以依法向人民法院提起行政诉讼。在行政诉讼中，法院将对拆迁程序的合法性进行全面审查，并作出判决。如果法院确认拆迁程序违法，被拆迁人可以据此要求拆迁方承担赔偿责任或采取其他补救措施。

8. 考虑其他途径

   • 媒体曝光：在合法合规的前提下，可以通过新闻媒体或社交平台聚焦问题，引发社会关注。借助舆论压力，有时可以促使拆迁方依法解决问题。
   • 信访部门：按照信访条例规定的程序提交投诉，寻求政府部门的帮助和解决。信访部门在处理拆迁纠纷时，可能会协调相关部门进行调查和处理。
   • 非政府组织：寻求相关非政府组织或法律援助机构的协助。这些组织通常具有专业的法律知识和丰富的实践经验，可以为被拆迁人提供法律支持和帮助。

在采取上述措施时，被拆迁人应注意以下几点：

• 保持冷静和理性，避免采取过激行为或言语攻击拆迁方，以免加剧矛盾或引发不必要的法律纠纷。
• 及时咨询并委托专业律师进行法律分析和策略制定，确保维权行动的合法性和有效性。
• 密切关注拆迁程序的进展和拆迁方的动态，及时调整维权策略以应对可能出现的新情况和新问题。