保险公司依据调解协议赔偿后，在一定条件下可以依据调解协议向侵权人追偿。具体分析如下：

1. 调解协议的法律效力
   调解协议若经双方自愿签署且内容合法，通常具有民事合同效力（《民法典》第464条）。若协议明确约定保险公司赔偿后取得对侵权人的追偿权（如“保险公司赔付后，被保险人将索赔权转让给保险公司”），则保险公司可直接依据协议主张权利。此时，侵权人不得以“已与被保险人达成和解”为由抗辩，除非能证明调解协议存在欺诈、胁迫等法定无效情形。

2. 法定追偿权的适用
   即使调解协议未明确约定追偿权，保险公司仍可能基于法定情形追偿：

   • 交强险领域：根据《机动车交通事故责任强制保险条例》第22条，若侵权人存在无证驾驶、醉酒驾驶等情形，保险公司赔付后有权向侵权人全额追偿。
     
   • 财产保险领域：依据《保险法》第60条，因第三者对保险标的的损害造成保险事故的，保险公司自向被保险人赔偿保险金之日起，在赔偿金额范围内代位行使被保险人对第三者请求赔偿的权利。此处的“第三者”即包括侵权人，且追偿权不因调解协议的存在而消灭。

3. 追偿的限制条件

   • 被保险人已放弃权利：若被保险人在调解协议中明确放弃对侵权人的索赔权（如约定“不再向侵权人主张任何赔偿”），且保险公司知情或应当知情，则保险公司追偿可能受阻（《保险法》第61条）。
     
   • 赔偿范围超出保险责任：若保险公司赔付金额包含非保险事故导致的损失（如被保险人自身过错扩大的损失），则超出部分不得向侵权人追偿。
     
   • 诉讼时效：追偿权适用三年诉讼时效，自保险公司实际赔偿之日起计算（《民法典》第188条）。

实务建议：

• 保险公司参与调解时，应在协议中明确约定追偿权条款（如“保险公司赔付后，被保险人授权其直接向侵权人追偿”），并要求侵权人签字确认。
  
• 若调解协议未涉及追偿权，保险公司可依据《保险法》第60条直接起诉侵权人，但需提供赔偿凭证、事故责任认定书等证据。
  
• 侵权人若主张被保险人已放弃权利，需承担举证责任（如提供调解协议原件、录音等证据）。

如有具体案件细节（如调解协议内容、事故责任划分等），可进一步向我咨询以制定针对性策略。