协议由一方手写并让对方单方签字，这样的协议在符合一定条件下是有效的。以下是对此问题的详细分析：
有效的情况
内容合法合规：
- 协议的内容必须严格遵守法律法规的强制性规定，不得涉及任何违法活动或违背公序良俗的内容。例如，如果手写协议是关于合法的商品买卖、服务提供等，且条款合理、明确，那么这样的协议在内容上是合法的，具备有效的基础。
对方自愿签订：
- 尽管协议是由一方手写，但对方在签字时必须是基于真实意愿，不存在欺诈、胁迫、重大误解等不正当手段。如果对方是在充分理解协议内容并自愿签字的情况下，那么这份协议在签订过程上是合法的，具有法律效力。
双方具备民事行为能力：
- 签订协议的双方当事人都必须具有相应的民事行为能力。对于成年人而言，除非存在精神异常等情况，否则一般均视为具备行为能力。如果双方都是具备民事行为能力的成年人，那么他们签订的手写协议在主体资格上是合法的。
形式符合一般要求：
- 虽然手写协议并非所有类型协议的标准形式，但法律并未禁止手写协议的有效性。只要协议内容清晰、明确，且双方对协议内容无异议，手写协议同样可以具备法律效力。当然，对于某些特定类型的协议（如房地产买卖合同、贷款合同等），法律可能规定了更为严格的形式要求（如需要公证或见证），在这种情况下，手写协议可能无法满足形式要求而无效。但就一般情况而言，手写协议在形式上是可接受的。
需要注意的风险点
证据留存问题：
- 手写协议相比打印协议，在证据留存方面可能存在一定风险。如果协议内容发生争议，手写部分的字迹清晰度、是否被篡改等都可能成为争议焦点。因此，在签订手写协议时，建议双方各留一份原件，并尽可能通过拍照、扫描等方式留存电子版备份。
特定协议的形式要求：
- 如前所述，某些特定类型的协议可能要求采用更为严格的书面形式，甚至需要公证或见证。在签订这类协议时，如果仅采用手写形式并让对方单方签字，可能无法满足法律要求而导致协议无效。因此，在签订协议前，建议先了解相关法律法规对协议形式的具体要求。
建议：在签订手写协议时，双方应确保协议内容的合法性、签订的自愿性、双方的行为能力以及形式的符合一般要求。如果可能的话，可以考虑在协议上加盖双方印章或按手印以增加协议的正式性和可信度。同时，为了降低风险，建议在签订协议前咨询专业律师的意见。如果你有任何具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。