针对您提出的“公交车起步了等跑来的乘客是否违规，以及如何处理”的问题，我们可以从两个方面来详细解答：
一、公交车起步后等待跑来乘客的行为性质
首先，我们需要明确的是，公交车作为公共交通工具，其运行应当遵循既定的线路和时间表，以确保公共交通的秩序和效率。公交车起步后，若非特殊情况（如乘客因突发状况如摔倒、突发疾病等无法及时上车），一般不应等待跑来的乘客。因为这种行为可能会干扰公交车的正常运行秩序，影响其他乘客的出行时间，甚至在某些情况下可能构成安全隐患。
然而，如果公交车司机在起步后，因看到有乘客在追赶且情况较为紧急（如乘客携带重物、行动不便或距离不远等），出于人道主义考虑而短暂停车等待，这通常不被视为违规行为。但这种情况应当是例外，而非常规操作。
二、若公交车司机违规等待跑来乘客或乘客强行要求等待的处理方式
对于公交车司机：
- 如果公交车司机因非特殊原因违规等待跑来的乘客，导致公交车运行秩序混乱或影响其他乘客出行，这可能违反了公交公司的运营规定。公交公司可以根据内部规定对司机进行相应的处罚，如警告、罚款或停职等。
- 若司机的行为严重到构成违反《中华人民共和国道路运输条例》或《道路旅客运输及客运站管理规定》的情形（如不按照规定的线路行驶、擅自停车等），则可能由县级以上道路运输管理机构责令改正，并处以罚款；情节严重的，还可能吊销相应许可。
对于乘客：
- 如果乘客因个人原因未能及时赶上公交车，而强行要求司机等待或采取其他干扰公交车正常运行的行为，这是不恰当的。乘客应当尊重公交车的运行秩序和其他乘客的出行权益。
- 若乘客的行为构成妨害公共交通工具安全驾驶（如抢夺方向盘、殴打驾驶人员等），则根据《关于依法惩治妨害公共交通工具安全驾驶违法犯罪行为的指导意见》，将依法从严惩处，可能构成以危险方法危害公共安全罪等严重犯罪。
建议：
- 对于公交车司机，建议严格遵守公交公司的运营规定和道路交通安全法规，确保公交车的正常运行秩序和乘客的出行安全。
- 对于乘客，建议提前规划好出行时间，尽量提前到达公交站点等待公交车。若因特殊原因未能及时赶上公交车，应理解并尊重公交车的运行秩序，不要强行要求等待或采取其他干扰行为。
- 若遇到公交车司机违规操作或乘客干扰公交车正常运行的情况，可以向公交公司或相关部门投诉举报，以维护公共交通的秩序和安全。