拆迁安置补偿协议的保管部门并非单一，而是可能涉及多个主体，具体取决于地区、项目以及管理方式的不同。以下是对拆迁安置补偿协议保管情况的详细解答：

一、被拆迁人保管

在签订拆迁安置补偿协议后，被拆迁人（即房屋的所有权人或合法使用权人）通常会持有一份协议原件。这是保障被拆迁人权益的重要文件，被拆迁人应仔细核对协议内容，确保无误后妥善保存。协议原件是证明被拆迁人与拆迁方之间权利义务关系的关键证据，在后续可能出现的争议或纠纷中起着至关重要的作用。

二、房屋征收部门保管

房屋征收部门也是拆迁安置补偿协议的重要保管方。根据相关法规，房屋征收部门负责组织实施本行政区域的房屋征收与补偿工作，并与被征收人签订补偿协议。房屋征收部门保管拆迁协议原件的目的在于确保协议的合法性和有效性，便于后续的管理和监督，同时保障被拆迁人的合法权益，防止协议被篡改或丢失。

三、其他相关部门或机构保管

1. 档案管理机构：在一些地区，拆迁安置补偿协议可能会被移交至当地的档案管理机构进行长期保存。这有助于实现档案的规范化和信息化管理，提高档案利用效率。如果因特殊原因需要查询历史档案中的拆迁补偿协议，可能需要向档案管理机构提交申请，并遵循其规定的查询流程和手续。

2. 公证处：如果拆迁安置补偿协议经过了公证程序，那么公证处也会保留一份协议原件或复印件作为公证档案的一部分。公证处的保管可以确保协议的真实性和合法性，为被拆迁人提供额外的法律保障。

四、特殊情况下的保管

在某些特殊情况下，如通过司法强拆程序，法院可能会要求将拆迁安置补偿协议等文件提交给法院备案，此时法院也会成为拆迁协议的一个保管方。但这种情况较为特殊，并非普遍现象。

总结与建议：

拆迁安置补偿协议的保管涉及多个部门，被拆迁人应首先确保自己持有一份协议原件，并妥善保管。同时，了解房屋征收部门、档案管理机构以及可能涉及的公证处等部门的保管情况，以便在需要时能够及时查询或复印协议。如果因特殊原因需要查询历史档案中的拆迁补偿协议，建议提前了解相关部门的查询流程和手续，以便顺利办理。