结论：侵占耕地侵权并未终了，但自发现之日起已过三年，是否还能要土地损害赔偿，需分情况讨论。

分析：

1. 诉讼时效的基本规定：

   • 根据《中华人民共和国民法典》第一百八十八条，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。法律另有规定的，依照其规定。诉讼时效期间自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。

2. 侵权行为持续时的诉讼时效：

   • 在侵占耕地的情况下，如果侵权行为持续存在，即侵权并未终了，那么诉讼时效的计算会有所不同。根据相关法律原则，对于持续性的侵权行为，诉讼时效通常从侵权行为终止之日起计算。这意味着，如果侵占耕地的行为一直在持续，那么即使自发现之日起已过三年，只要侵权行为尚未终止，权利人仍然有权要求土地损害赔偿。

3. 特殊情况下的诉讼时效延长：

   • 除了持续性侵权行为外，还有一些特殊情况可能导致诉讼时效的延长。例如，如果权利人在诉讼时效期间内因不可抗力或其他正当理由无法行使请求权，诉讼时效可以中止，从中止时效的原因消除之日起满六个月，诉讼时效期间届满。此外，如果权利人向义务人提出履行请求、义务人同意履行义务等情形，也可能导致诉讼时效的中断和重新计算。

4. 实际操作中的建议：

   • 在面对侵占耕地且侵权行为持续的情况时，权利人应尽快收集相关证据，如土地权属证明、侵权行为照片或视频、证人证言等，以证明自己的权利受到侵害以及侵权行为的存在和持续。
   • 同时，权利人应及时向相关部门（如土地管理部门、农业部门等）报告侵权行为，并寻求法律援助或咨询专业律师，以了解自己的权利和可行的法律途径。
   • 如果侵权行为已经持续多年，且权利人担心诉讼时效问题，可以咨询律师以评估具体情况，并考虑是否可以通过法律途径要求赔偿。

总结与建议：

• 如果侵占耕地的侵权行为持续存在，权利人仍然有权要求土地损害赔偿，不受三年诉讼时效的限制（从侵权行为终止之日起计算）。
• 权利人应尽快收集证据并寻求法律援助，以评估自己的权利和可行的法律途径。
• 在实际操作中，权利人应密切关注侵权行为的动态，并在必要时及时采取法律行动以保护自己的权益。

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