当支付令异议终结后，根据相关法律规定及司法实践，通常会转入诉讼程序。以下是对这一过程的详细解释：
一、转入诉讼程序的基本规定
根据新民事诉讼法的相关规定，当债务人提出书面异议且经人民法院审查认为异议成立时，支付令将自行失效，并裁定终结督促程序。此后，除非申请支付令的一方当事人明确表示不同意提起诉讼，否则案件将自动转入诉讼程序。这一规定旨在简化诉讼环节，提高诉讼效率。
二、转入诉讼程序的具体操作
案号问题：
- 尽管支付令程序与普通诉讼程序在审理各环节的操作规定上有所不同，但转入诉讼程序后，仍需立一个新的诉讼程序案号。这有助于法院对案件进行统一管理和审理。
- 在裁定文书中，法院会说明案件是从支付令程序自动转入诉讼程序的，以确保案件的连续性和可追溯性。
诉讼费问题：
- 支付令的收费标准通常为普通诉讼案件收费的三分之一。当案件转入诉讼程序后，申请人可能需要补缴剩余的诉讼费用。这是因为诉讼程序相较于支付令程序更为复杂，需要更多的司法资源。
- 具体是否需要补缴以及补缴的金额，应根据当地法院的具体规定和案件情况来确定。
起诉状问题：
- 在转入诉讼程序时，法院可能会要求申请人重新补交起诉状及副本。这是因为诉讼程序需要更详细的诉讼请求和事实依据，以便法院进行审理和判决。
- 申请人应按照法院的要求，及时、准确地提交起诉状及相关证据材料。
诉讼请求变更与当事人追加：
- 在转入诉讼程序后，申请人有权根据案件情况变更诉讼请求或追加当事人。例如，如果原支付令仅针对债务人发出，而债务人设有担保，那么转入诉讼程序后，申请人可以一并向债务人和担保人主张债权。
- 法院在审理过程中，会根据申请人的请求和案件情况，依法进行相应的处理。
三、转入诉讼程序的意义
支付令异议终结后转入诉讼程序，有助于更全面地审查案件事实，保护当事人的合法权益。诉讼程序提供了更充分的举证、质证和辩论机会，使得案件能够得到更公正、更准确的判决。同时，这也体现了司法程序的严谨性和公正性。
综上所述，当支付令异议终结后，案件通常会转入诉讼程序进行审理。申请人应了解并遵守相关法律规定和法院要求，积极配合法院的审理工作，以维护自己的合法权益。