在医疗期内，如果用人单位与劳动者协商解除劳动合同，那么关于补偿的问题，需要依据相关法律法规来详细阐述。

首先，我们要明确的是，医疗期内用人单位不得随意解除劳动合同，这是《劳动合同法》及相关法律法规的明确规定。但如果双方协商一致解除劳动合同，那么用人单位需要按照法律规定向劳动者支付相应的经济补偿。

经济补偿的计算

1. 基本计算方式：

   • 经济补偿通常按照劳动者在本单位工作的年限来计算，每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。
   • 如果工作六个月以上但不满一年，也按一年计算；不满六个月的，则向劳动者支付半个月工资的经济补偿。

2. 月工资标准：

   • 月工资是指劳动者在劳动合同解除或终止前十二个月的平均工资。
   • 如果劳动者工作不满十二个月，则按实际工作的月数来计算平均工资。

3. 特殊限制：

   • 如果劳动者的月工资高于当地上年度职工月平均工资的三倍，那么经济补偿的标准将按照职工月平均工资三倍的数额来支付，且支付年限最高不超过十二年。

4. 赔偿金：

   • 如果是用人单位违法解除劳动合同（而非协商解除），那么劳动者有权要求用人单位支付赔偿金，赔偿金为经济补偿标准的二倍。但在协商解除的情况下，通常只支付经济补偿，不支付赔偿金。

医疗补助费

除了经济补偿外，如果劳动者因患病或非因工负伤，在医疗期内经劳动鉴定委员会确认不能从事原工作，也不能从事用人单位另行安排的工作，而双方协商解除劳动合同的，用人单位还应当支付医疗补助费。

1. 基本标准：

   • 医疗补助费通常不低于六个月工资。

2. 增加部分：

   • 如果劳动者患重病，医疗补助费应增加不低于其百分之五十；
   • 如果患绝症，医疗补助费应增加不低于其百分之百。

实际操作建议

1. 协商过程：

   • 在协商解除劳动合同的过程中，劳动者应明确自己的权益，包括经济补偿和医疗补助费等。
   • 用人单位也应遵守法律法规，按照标准向劳动者支付相应的补偿。

2. 证据收集：

   • 劳动者应收集好相关证据，如劳动合同、工资条、医疗诊断证明、病假申请及审批记录等，以证明自己的劳动关系、医疗期及应得的补偿。

3. 咨询专业律师：

   • 由于法律法规可能随时间变化而更新，且具体案件情况可能有所不同，因此建议劳动者在处理此类问题时咨询专业律师，以确保自身权益得到充分保护。

举例说明

假设劳动者在某单位工作了3年7个月，前12个月平均工资为5000元，且因患病在医疗期内与用人单位协商解除劳动合同。那么：

• 经济补偿：4个月工资（3年按3个月计算，7个月按1个月计算）× 5000元/月 = 20000元；
• 医疗补助费：至少6个月工资 × 5000元/月 = 30000元（若患重病或绝症，还需按相应比例增加）。

综上所述，医疗期内协商解除劳动合同的补偿问题需根据具体情况来确定，包括经济补偿和医疗补助费等。劳动者应充分了解相关法律法规，积极维护自身合法权益。