结论：保险公司是否赔偿需分情况讨论，主要取决于您购买的保险类型、事故责任认定以及保险条款的具体约定。以下是具体分析：

1. 如果您购买了车损险
   车损险的赔偿范围通常包括火灾、爆炸等意外事故导致的车辆损失。若您的车辆因第三方车辆自燃被烧毁，属于“火灾”导致的直接损失，保险公司一般应予以赔偿。但需注意：

   • 保险公司可能要求您提供事故证明（如消防部门出具的火灾原因认定书），以确认自燃车辆是事故的直接原因；
     
   • 若自燃车辆的车主已购买交强险或第三者责任险，您的保险公司可能在赔付后向对方追偿（即“代位求偿”）。

2. 如果您仅购买了交强险或第三者责任险
   这两种保险仅赔偿您对第三方造成的损失，不覆盖您自身车辆的损失。因此，若您未购买车损险，保险公司不会对您的车辆损失进行赔偿。

3. 若自燃车辆的车主无责或无法赔偿
   即使自燃车辆的车主无过错（如车辆因质量问题自燃），您的车损险仍应赔偿您的损失。但若自燃车辆的车主未购买保险或无力赔偿，且您未购车损险，则可能面临无法获赔的风险。

建议行动步骤：

1. 立即报警并联系消防部门，获取火灾原因认定书，明确事故责任；
   
2. 联系您的保险公司报案，提供事故证明和相关材料（如现场照片、维修报价等）；
   
3. 若保险公司拒赔或赔偿不足，可依据《保险法》和合同条款主张权利，必要时通过法律途径解决。
   

如有其他细节需要进一步分析（如保险条款的具体约定、事故现场情况等），可直接向我咨询。