冒名顶替工作二十年被发现，单位应立即解除劳动合同，并依法追究冒名顶替者的法律责任，同时加强内部管理以防止类似事件再次发生。以下是对此问题的详细分析：
一、单位处理冒名顶替者的法律依据与程序
解除劳动合同：
- 法律依据：根据《中华人民共和国劳动合同法》第二十六条，以欺诈手段订立的劳动合同无效。冒名顶替者通过伪造身份信息、学历证书等手段与单位订立劳动合同，属于欺诈行为，因此该劳动合同无效。单位可依据此条款解除劳动合同，且无需支付经济补偿。
- 程序要求：单位应提前通知冒名顶替者解除劳动合同的决定，说明理由和依据，并办理离职手续。在通知过程中，单位应确保通知内容准确无误，并保留好相关证据，以备后续可能出现的法律纠纷。
追究法律责任：
- 刑事责任：冒名顶替行为可能涉嫌犯罪，如使用虚假身份证件、伪造国家机关公文等。根据《中华人民共和国刑法》相关规定，冒名顶替者可能面临三年以下有期徒刑、拘役、管制、剥夺政治权利或罚金等处罚。单位应及时向公安机关报案，并配合公安机关的调查工作。
- 行政责任：冒名顶替者还可能面临罚款、吊销证件等行政处罚。具体责任形式需根据相关行政法规确定。单位在发现冒名顶替行为后，应向相关行政部门报告，并协助行政部门进行调查和处理。
- 民事责任：冒名顶替行为侵犯了被冒名人的姓名权等人格权利。被冒名人有权提起民事诉讼，要求冒名顶替者承担停止侵害、恢复名誉、消除影响、赔礼道歉及赔偿损失等责任。单位在处理冒名顶替事件时，应告知被冒名人其享有的权利，并协助被冒名人维护其合法权益。
经济追偿：
- 追回不当得利：单位有权要求冒名顶替者返还工资、奖金、社会保险等所有不当得利。若冒名顶替者拒绝返还，单位可通过法律途径追讨，如向法院提起诉讼或申请仲裁等。
- 赔偿损失：如冒名顶替行为给单位造成经济损失，单位有权要求其承担赔偿责任。赔偿金额应根据实际损失确定，并提供相应证据。单位在追偿过程中，应确保证据充分、合法，以支持其赔偿请求。
二、单位内部整改与预防措施
完善招聘与入职审核：
- 加强背景调查，核实学历、工作经历及身份信息。单位在招聘过程中，应要求应聘者提供真实、完整的个人信息和证明材料，并通过多种渠道进行核实。
- 严格身份验证，采用多种验证方式确保入职人员身份真实可靠。单位可采用人脸识别、指纹识别等生物识别技术进行身份验证，以提高验证的准确性和可靠性。
加强员工管理与监督：
- 建立员工诚信档案，记录不诚信行为，并在晋升、奖励等方面进行限制。单位应定期对员工进行诚信教育，提高员工的诚信意识，并对不诚信行为进行严肃处理。
- 定期开展内部审计和检查，及时发现和纠正问题。单位应建立内部审计机制，定期对员工的工作表现、考勤记录等进行检查，以确保员工遵守单位规章制度和法律法规。
建立举报机制与法律宣传：
- 鼓励员工举报违法行为，对举报人给予保护和奖励。单位应建立举报机制，明确举报渠道和奖励措施，鼓励员工积极举报违法行为，并对举报人进行保护和奖励。
- 通过法律宣传和教育，提高员工对冒名顶替等违法行为的认知和警惕性。单位应定期组织法律宣传活动，向员工普及法律法规知识，提高员工的法律意识和风险防范能力。
总结与建议：冒名顶替工作二十年被发现，单位应立即解除劳动合同，并依法追究冒名顶替者的法律责任。同时，单位应加强内部管理，完善招聘和入职审核流程，加强员工管理与监督，建立举报机制与法律宣传，以防止类似事件再次发生。若您在处理此类事件时遇到法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。