在应急车道停车上厕所属于非紧急情况占用应急车道，会被扣分并罚款。具体分析如下：

1. 法律依据与处罚标准
   根据《道路交通安全法实施条例》第八十二条第四项规定，机动车在高速公路上行驶时，非紧急情况不得在应急车道行驶或停车。若违反此规定，将面临扣6分、罚款200元的处罚（依据《道路交通安全违法行为记分管理办法》第十条第十一项）。

2. “紧急情况”的认定
   应急车道的设立初衷是供警车、消防车、救护车等执行紧急任务时使用，或供车辆在发生故障、事故等紧急情况下临时停靠。“上厕所”不属于法律认可的紧急情况，即使因内急停车，也可能被认定为违规。

3. 特殊情形说明

   • 若车辆突发故障（如爆胎、刹车失灵）或驾驶员突发疾病（如昏迷、剧烈疼痛），需立即停车的，可免于处罚，但需开启双闪灯、在车后150米外放置警示标志，并迅速报警或联系救援。
     
   • 实践中，部分驾驶员以“身体不适”为由辩解，但需提供医疗证明等证据，否则仍可能被处罚。

4. 建议与风险提示

   • 高速公路行车前应提前规划休息区或服务区停车，避免因内急冒险占用应急车道。
     
   • 若已违规停车，切勿试图通过伪造证据（如谎称车辆故障）逃避处罚，否则可能涉嫌妨碍公务，面临更严厉处罚。
     
   • 如对处罚有异议，可依法申请行政复议或提起行政诉讼，但需在收到处罚决定书后60日内提出。

总结：应急车道停车上厕所属于违规行为，会被扣分罚款。若遇紧急情况需停车，务必按规范操作并保留证据，以降低法律风险。如有其他交通法律问题，可直接向我咨询。