是的，在高速路应急车道停车小便被抓住，一般情况下是会被扣9分的。以下从不同角度为你详细分析：

法律依据

根据《道路交通安全违法行为记分管理办法》第九条第三项规定，驾驶机动车在高速公路或者城市快速路上违法停车的，一次记9分。这里的“违法停车”就包括了非紧急情况下在应急车道停车的行为。应急车道是供工程救险、消防救援、医疗救护或执行紧急公务等处理应急事务的车辆使用的，非紧急情况下不得占用。

紧急情况例外

不过，也存在一些特殊情况。如果驾驶员或乘客确实遇到了紧急的生理状况，比如突发疾病、身体严重不适等，需要立即停车处理，且能够提供相应的证据（如医院的诊断证明等）来证明当时情况的紧急性，那么在这种情况下停车，可能不会被认定为违法停车，也就不会扣分。但仅仅是因为小便这种相对可以提前规划、避免的情况，通常不被认为是紧急情况。

处罚措施

除了扣分之外，根据《中华人民共和国道路交通安全法》第九十条规定，机动车驾驶人违反道路交通安全法律、法规关于道路通行规定的，处警告或者二十元以上二百元以下罚款。所以，在高速路应急车道停车小便，除了扣9分外，还可能面临罚款的处罚。

实际建议

为了避免不必要的扣分和罚款，建议驾驶员在出行前做好充分的准备，规划好行程，提前解决好个人生理需求。如果在行驶过程中确实需要停车，应该尽量选择在服务区、停车区等合法停车地点停车。

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