不建议将股东老板汇款付工资备注为借款，这种操作存在法律和财务上的风险，以下从不同角度为你详细分析：

从劳动法律关系角度

1. 工资支付义务：根据《中华人民共和国劳动法》和《中华人民共和国劳动合同法》等相关规定，用人单位有义务按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。工资是劳动者提供劳动后应得的报酬，这是明确的法律义务。如果将工资备注为借款，从形式上改变了这笔款项的性质，可能被认定为未依法支付工资。
2. 潜在纠纷风险：一旦备注为借款，在后续可能引发劳动纠纷时，劳动者可能会主张这笔款项并非工资，而是借款，要求股东老板偿还。而股东老板则可能主张这是工资支付，双方会产生争议。在劳动争议处理中，这种备注可能会给用人单位带来不利后果，增加用人单位的举证难度和败诉风险。

从财务和税务角度

1. 财务核算混乱：在企业的财务核算中，工资和借款是不同的会计科目，有着不同的核算方法和处理流程。将工资备注为借款会导致财务账目混乱，无法准确反映企业的真实财务状况和经营成果。这不仅会影响企业内部的管理决策，还可能在接受税务、审计等外部监管时出现问题。
2. 税务风险：工资支付涉及到个人所得税的代扣代缴义务。企业作为工资支付方，需要按照规定计算并代扣代缴劳动者的个人所得税。如果将工资备注为借款，可能会被税务机关认为企业未履行代扣代缴义务，从而面临税务处罚。同时，借款在企业所得税处理上也有其特定的规定，错误的备注可能导致企业税务处理不当，增加税务成本。

从股东与公司关系角度

1. 公司财产独立性：公司具有独立的法人财产权，股东的出资形成公司的财产，股东不得随意抽回出资或侵占公司财产。如果股东老板以借款形式支付工资，可能会被认定为变相抽逃出资或侵占公司财产，损害公司和其他股东的利益。这不仅违反了公司法的相关规定，还可能引发股东之间的纠纷。
2. 影响公司信用：这种不规范的操作可能会影响公司的信用和声誉。在与其他企业或金融机构进行业务往来时，对方可能会对公司的财务状况和经营规范性产生质疑，从而影响公司的商业合作和融资能力。

建议：股东老板应按照法律规定和财务规范，以工资的形式准确、及时地向劳动者支付劳动报酬，避免使用借款等不规范的方式进行操作。如果确实存在资金周转等特殊情况，需要临时借款给公司，应按照公司章程和相关法律法规的规定，履行相应的审批程序，并签订合法的借款协议，明确借款的用途、期限、利息等事项。

如果你在股东与公司关系、劳动法律、财务税务等方面还有其他疑问，欢迎继续向我咨询。