车主垫付的2000元医药费，在符合保险合同约定和法律规定的情况下，保险公司通常会予以赔偿。具体分析如下：

1. 保险责任范围
   根据《机动车交通事故责任强制保险条例》及商业第三者责任险条款，保险公司需对被保险车辆造成的第三方人身伤亡承担赔偿责任。医药费属于法定赔偿项目，只要垫付费用与事故直接相关（如急救费、治疗费等），且未超出保险限额，保险公司应予以理赔。

2. 垫付行为的合法性
   若车主垫付费用时未违反法律或保险合同禁止性规定（如酒驾、逃逸等），且垫付金额在保险责任范围内，保险公司需赔偿。但需注意：

   • 票据保留：车主需妥善保存垫付的医药费发票、诊断证明等材料，作为理赔依据；
     
   • 及时报案：事故发生后应立即向保险公司报案，避免因延迟报案影响理赔。

3. 理赔流程与注意事项

   • 提交材料：向保险公司提交垫付凭证、医疗记录、事故认定书等文件；
     
   • 定损与核价：保险公司会审核费用合理性，剔除非必要项目（如过度治疗费用）；
     
   • 赔偿对象：若车主已垫付，保险公司可能将赔偿款直接支付给车主，或按车主指示支付给伤者。

4. 特殊情形处理

   • 超出交强险限额：若医药费超过交强险医疗费用赔偿限额（通常为1.8万元），超出部分需通过商业险或车主自行承担；
     
   • 责任比例划分：若车主负部分责任，保险公司按责任比例赔偿垫付费用（如车主负70%责任，则赔偿垫付金额的70%）。

建议：

• 垫付前与保险公司沟通，确认费用合理性及理赔流程；
  
• 保留所有垫付凭证，避免现金支付导致无法举证；
  
• 若理赔受阻，可依据《保险法》要求保险公司说明拒赔理由，或通过诉讼解决争议。
  

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