结论：人民法院驳回以物抵债协议后，债权人当然可以继续主张债权。关于诉讼时效，需根据具体情况来判断是否已过诉讼时效期间。
一、债权人可继续主张债权
以物抵债协议，本质上是一种债务清偿的方式，它并不改变原债权债务关系的本质。当人民法院驳回以物抵债协议时，通常意味着该协议因某种原因（如协议内容违法、存在欺诈或胁迫等情形）不被法院认可，但这并不影响原债权债务关系的存在。因此，债权人仍然有权依据原债权债务关系，向债务人主张债权。
二、诉讼时效的规定
诉讼时效是指民事权利受到侵害的权利人在法定的时效期间内不行使权利，当时效期间届满时，债务人获得诉讼时效抗辩权。在债权债务关系中，诉讼时效的规定对于债权人主张权利至关重要。
一般规定：
- 根据《中华人民共和国民法典》第一百八十八条，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。法律另有规定的，依照其规定。
- 诉讼时效期间自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。法律另有规定的，依照其规定。但是，自权利受到损害之日起超过二十年的，人民法院不予保护，有特殊情况的，人民法院可以根据权利人的申请决定延长。
在债权债务关系中的具体应用：
- 如果债权人与债务人之间有明确的还款期限约定，那么诉讼时效期间通常从还款期限届满之日起计算。
- 如果债权人与债务人之间没有明确的还款期限约定，或者还款期限约定不明确，那么诉讼时效期间可能从债权人要求债务人履行还款义务的宽限期届满之日起计算，或者从债权人知道或应当知道债务人拒绝履行还款义务之日起计算。
诉讼时效的中断与中止：
- 在诉讼时效期间内，如果债权人向债务人提出履行请求、债务人同意履行义务、债权人提起诉讼或申请仲裁等情形，诉讼时效会中断，并从中断、有关程序终结时起重新计算。
- 如果因不可抗力或其他障碍不能行使请求权，诉讼时效会中止，并从中止时效的原因消除之日起满六个月，诉讼时效期间届满。
三、建议
- 及时主张权利：债权人应在诉讼时效期间内及时向债务人主张权利，以避免因诉讼时效届满而丧失胜诉权。
- 保留证据：债权人应保留好与债务人之间的债权债务关系相关的证据，如借条、转账记录、聊天记录等，以便在需要时向法院提供。
- 咨询专业律师：如果债权人对诉讼时效的计算或主张权利的方式有疑问，建议咨询专业律师，以获取更准确的法律意见。
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