结论：债权人未在民间借贷诉讼中提交以物抵债协议，判决生效后，一般不能再据此直接主张权利提起新的诉讼，但存在例外情况。以下从不同角度进行详细分析：
一、一般原则：一事不再理
在民事诉讼中，遵循“一事不再理”的原则，即对于已经发生法律效力的判决、裁定，当事人不得就同一事实和理由再次提起诉讼。这一原则旨在维护司法裁判的稳定性和权威性，避免重复诉讼和司法资源的浪费。
判决生效后的效力：一旦民间借贷诉讼的判决生效，该判决即具有法律上的确定力和执行力。债权人应当依据该判决来主张自己的权利，如申请强制执行等。
以物抵债协议的性质：以物抵债协议通常被视为债务履行的一种方式，而非独立的诉讼请求。如果债权人在原诉讼中未提交该协议，且判决已经生效，那么该协议一般不能作为新的诉讼请求的依据。
二、例外情况：新的事实或证据
尽管存在“一事不再理”的原则，但在某些特定情况下，债权人仍可能基于新的事实或证据提起新的诉讼。
新证据的出现：如果债权人在判决生效后发现了新的证据，该证据足以证明原判决存在错误或遗漏，且该证据与以物抵债协议直接相关，那么债权人可能可以依据该新证据提起再审或新的诉讼。但这种情况较为罕见，且需要满足严格的法律条件。
协议履行中的问题：如果以物抵债协议在判决生效后开始履行，但在履行过程中出现了问题，如债务人拒绝履行、协议内容存在争议等，债权人可能可以就这些问题提起新的诉讼。但这种情况下的诉讼通常不是直接基于原借贷关系，而是基于以物抵债协议的履行问题。
三、法律建议
在原诉讼中充分举证：为了避免判决生效后出现无法主张权利的情况，债权人在提起民间借贷诉讼时，应当尽可能充分地举证，包括提交以物抵债协议等关键证据。
及时咨询专业律师：如果债权人在判决生效后才发现以物抵债协议等关键证据未提交，或者对判决结果存在异议，应当及时咨询专业律师，了解自己的权利和义务，以及可能的法律救济途径。
考虑其他救济方式：如果债权人无法通过诉讼途径主张权利，还可以考虑其他救济方式，如与债务人协商、申请仲裁等。
总结：债权人未在民间借贷诉讼中提交以物抵债协议，判决生效后一般不能再据此直接主张权利提起新的诉讼。但存在例外情况，如新证据的出现或协议履行中的问题。因此，债权人在处理此类问题时应当谨慎行事，及时咨询专业律师，了解自己的权利和义务。如果你有具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。