结论：公司垫付三千住院押金后要求退款是否合理，需根据具体情况判断，包括垫付的原因、双方约定以及相关法律规定等。以下从不同角度进行分析：

一、基于双方约定的角度

1. 若双方有明确约定：如果公司与员工（或相关方）在垫付住院押金时，有明确的书面或口头约定，比如约定在特定条件下（如员工康复后、保险理赔后等）需要退还公司垫付的押金，那么公司要求退款就是合理的。这种情况下，双方应当按照约定履行各自的义务。
2. 若双方无明确约定：如果双方在垫付时没有明确的约定，那么公司要求退款是否合理就需要根据其他因素来判断，比如垫付的性质、目的以及后续的发展情况等。

二、基于垫付性质的角度

1. 若垫付属于借款性质：如果公司垫付的住院押金在性质上属于借款，即公司出于帮助员工（或相关方）的目的，暂时提供资金支持，并期望在后续得到偿还，那么公司要求退款就是合理的。这种情况下，员工（或相关方）应当按照借款的约定或法律规定，及时退还公司垫付的资金。
2. 若垫付属于赠与性质：如果公司垫付的住院押金在性质上属于赠与，即公司出于慈善、关怀或其他非商业目的，无偿提供资金支持，并不期望得到偿还，那么公司要求退款就不合理。但这种情况相对较少，且通常需要有明确的赠与意思表示和证据支持。
3. 若垫付属于履行法定义务或合同义务：在某些情况下，公司可能因法律规定或合同约定而需要承担员工（或相关方）的医疗费用或相关费用。如果垫付的住院押金属于这种情况，那么公司要求退款就不合理，因为这是公司应尽的义务。

三、基于后续发展情况的角度

1. 若员工（或相关方）已获得保险理赔或其他补偿：如果员工（或相关方）在后续获得了保险理赔、社会救助或其他形式的补偿，且这些补偿足以覆盖公司垫付的住院押金，那么公司要求退款就是合理的。因为员工（或相关方）已经获得了足够的资金支持，无需再占用公司的资金。
2. 若员工（或相关方）未获得足够补偿且经济困难：如果员工（或相关方）在后续未获得足够的补偿，且经济困难无法退还公司垫付的资金，那么公司要求退款可能就不太合理。在这种情况下，公司可以考虑与员工（或相关方）协商，采取分期退还、减免部分费用等方式来解决问题。

法律建议

1. 审查相关证据：公司应首先审查与垫付住院押金相关的证据，如转账记录、收据、约定协议等，以明确垫付的性质、目的和双方的权利义务。
2. 与员工（或相关方）协商：在明确相关情况后，公司应与员工（或相关方）进行协商，就退款事宜达成一致意见。如果双方能够协商成功，可以签订书面协议来明确各自的权利义务。
3. 寻求法律途径解决：如果双方无法协商成功，公司可以考虑通过法律途径来解决争议。比如，可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁（如果涉及劳动关系），或者向人民法院提起诉讼（如果涉及其他法律关系）。

后续思考依据：在处理此类问题时，需要综合考虑多种因素，包括双方约定、垫付性质、后续发展情况等。同时，还需要注意保留相关证据，以便在需要时能够证明自己的主张。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。