结论：双方协议按份共有但房产办理在一方名下，可通过签订补充协议并办理产权变更登记手续，将房产变更至双方名下。具体操作步骤及注意事项如下：

1. 签订补充协议

   • 协议内容：双方应就房产的按份共有比例、各自的权利义务等事项签订书面补充协议。协议中应明确双方对房产的共有份额，例如甲方占XX%，乙方占XX%，并约定双方按照各自份额对房产享有占有、使用、收益和处分的权利。
   • 协议效力：补充协议是双方真实意思的表示，不违反法律、行政法规的强制性规定，自双方签字（或盖章）之日起生效，对双方具有法律约束力。

2. 办理产权变更登记手续

   • 准备材料：双方需携带身份证、房产证、补充协议等材料，共同前往不动产登记机构申请办理产权变更登记手续。
   • 登记流程：不动产登记机构将对双方提交的材料进行审核，确认无误后，将按照补充协议中约定的共有份额，在房产证上记载双方的名字及各自所占的份额。
   • 税费缴纳：在办理产权变更登记手续过程中，双方可能需要根据当地政策缴纳一定的税费，如契税、印花税等。具体税费标准可咨询当地不动产登记机构或税务部门。

3. 注意事项

   • 确保协议合法有效：双方签订的补充协议应符合法律法规的规定，不得损害国家、集体或第三人的利益。否则，协议可能被认定为无效，导致双方无法按照约定办理产权变更登记手续。
   • 及时办理变更登记：双方签订补充协议后，应及时前往不动产登记机构办理产权变更登记手续。未办理变更登记的，不影响补充协议的效力，但不得对抗善意第三人。也就是说，如果一方将房产擅自转让给第三人，且第三人不知情并支付了合理对价，那么第三人可能取得房产的所有权。
   • 保留相关证据：在办理产权变更登记手续过程中，双方应保留好相关证据，如补充协议、缴费凭证等。以备在发生纠纷时，能够证明自己的权益。