不在注册机构行医是否构成非法行医，这需要根据具体情况和法律规定来综合判断。以下是对这一问题的详细解答：
一、非法行医的定义
非法行医通常指的是未取得医生执业资格的人擅自从事医疗活动。然而，对于已取得执业资格的医师来说，不在注册的执业地点行医并不直接等同于非法行医，但必须符合相关法律规定或特殊情况。
二、合法跨执业地点行医的情形
会诊：医师经所在医疗机构批准，可以前往其他医疗机构为特定患者开展执业范围内的诊疗活动。例如，某医院专家应另一医院邀请前往会诊，这属于合法行为。
急救：在自然灾害、传染病流行等紧急情况下，医师可以服从卫生健康主管部门的调遣或自发前往救援，此时不受执业地点的限制。
家庭医生签约服务：按照政策和规定，医生可以为签约居民提供上门医疗服务，即使这超出了常规的执业地点范围，也属于合法范畴。
经批准的跨地点执业：如果医师事先经过了有关部门的批准，那么跨执业地点、类别或范围进行医疗活动同样不属于非法行医。
三、非法行医的情形与法律后果
未办理变更注册手续：如果医师未办理变更注册手续而在其他地点执业，虽然不构成非法行医罪，但可能会面临警告、责令暂停执业等行政处罚。
以牟利为目的的非法行医：如果医师以牟利为目的，故意规避执业地点管理规定，到其他地点进行执业活动，并造成严重后果，那么可能构成非法行医罪，面临刑事处罚及民事赔偿责任。
四、法律处罚与责任承担
行政处罚：根据相关规定，医师未按注册执业地点、类别、范围执业的，可能会受到卫生健康主管部门的责令改正、警告、没收违法所得以及罚款等处罚。情节严重者甚至可能被责令暂停执业活动直至吊销执业证书。
刑事处罚：对于未取得医生执业资格的人非法行医，或已取得执业资格的医师非法行医且情节严重的，可能会面临三年以下有期徒刑、拘役或者管制，并处罚金的刑事处罚。如果严重损害就诊人身体健康，还可能面临更长的刑期和更高的罚金。
民事赔偿：医师如果私自到非执业地点进行医疗活动并给患者造成损害，还需要承担民事赔偿责任，包括医疗费、误工费、护理费等各项费用。
综上所述，医师在执业过程中应严格遵守相关法律法规，确保行医行为的合法合规。对于跨执业地点行医的情况，应事先了解并遵守相关规定，以避免可能的法律风险。