医疗机构未履行药品进货查验制度，将面临行政处罚，情节严重的可能承担刑事责任，同时可能面临民事赔偿。具体分析如下：

1. 行政处罚
   根据《中华人民共和国药品管理法》第一百二十九条，医疗机构若未从药品上市许可持有人或具备资质的药品生产、经营企业购进药品，或未履行进货查验义务（如未查验供货单位资质、药品合格证明文件、检验报告等），药品监督管理部门将责令改正，给予警告；拒不改正的，处十万元以上五十万元以下的罚款。
   若情节严重（如长期未查验导致假劣药品流入、造成严重后果等），可处五十万元以上二百万元以下罚款，并可能对直接负责的主管人员和其他责任人员处二万元以上二十万元以下罚款，同时责令停业整顿直至吊销药品经营许可证。

2. 刑事责任（若构成犯罪）
   若未履行查验义务导致假药、劣药流入市场，且造成严重危害后果（如患者健康损害、死亡等），可能触犯《刑法》第一百四十一条（生产、销售假药罪）或第一百四十二条（生产、销售劣药罪）。医疗机构直接负责的主管人员和其他责任人员可能被追究刑事责任，处三年以下有期徒刑或拘役，并处罚金；后果特别严重的，处三年以上十年以下有期徒刑，并处罚金。

3. 民事赔偿
   若患者因使用未查验的药品遭受损害，医疗机构可能因未尽到安全保障义务而承担民事赔偿责任。根据《民法典》第一千二百二十三条，患者可要求医疗机构赔偿医疗费、护理费、残疾赔偿金等损失。

建议：医疗机构应严格建立并执行药品进货查验制度，留存供货单位资质、药品合格证明、购进票据等文件，定期自查整改。若已面临处罚或纠纷，可进一步向我咨询具体应对方案。