结论：在征收补偿决定政府自行撤回且法院同意政府撤回，但原告不同意撤诉的情况下，案件的走向主要取决于法院的进一步处理以及原告的诉讼策略。以下从多个角度进行详细分析：
一、法院可能的处理方式
裁定终结诉讼：
- 如果法院认为，由于政府已经撤回了征收补偿决定，原告诉求的基础已经不存在，且原告不同意撤诉并不影响诉讼基础的消失，法院可能会根据《中华人民共和国行政诉讼法》的相关规定，裁定终结诉讼。这意味着案件将不再继续审理，原告的诉讼请求将不会得到法院的进一步审查。
继续审理并作出判决：
- 另一种可能是，法院认为尽管政府撤回了征收补偿决定，但原告的诉讼请求可能还涉及其他方面，如政府撤回决定的合法性、原告因此遭受的损失等。在这种情况下，法院可能会继续审理案件，并就这些方面作出判决。如果法院认为政府的撤回决定违法或原告因此遭受了损失，法院可能会判决政府承担相应的法律责任。
二、原告的诉讼策略及可能后果
坚持不撤诉并寻求其他救济：
- 如果原告坚持不撤诉，并认为政府的撤回决定违法或自己因此遭受了损失，原告可以在诉讼中提出相应的诉讼请求，并寻求法院的支持。如果法院最终判决支持原告的诉讼请求，政府将需要承担相应的法律责任，如赔偿损失等。
考虑撤诉并寻求其他途径解决：
- 另一方面，如果原告认为继续诉讼可能无法获得期望的结果，或者考虑到诉讼成本和时间等因素，原告也可以选择撤诉。撤诉后，原告可以通过与政府协商、申请行政复议或其他途径来寻求问题的解决。
三、法律建议
评估诉讼基础和诉求：
- 原告应仔细评估自己的诉讼基础和诉求，考虑政府撤回征收补偿决定后，自己的诉讼请求是否仍然具有合理性和合法性。如果诉讼基础已经消失或诉求不再合理，原告应考虑撤诉以避免不必要的诉讼成本和时间浪费。
咨询专业律师并制定策略：
- 在面对这种情况时，原告应咨询专业律师的意见，了解自己的法律权利和诉讼策略。律师可以根据案件的具体情况和相关法律法规，为原告提供专业的法律建议和诉讼策略，帮助原告更好地维护自己的合法权益。
关注法院处理进展并及时应对：
- 原告应密切关注法院对案件的处理进展，及时了解法院的裁定或判决结果。如果法院裁定终结诉讼或作出不利于原告的判决，原告应根据律师的建议及时采取应对措施，如申请再审或寻求其他救济途径等。
总结来说，在征收补偿决定政府自行撤回且法院同意政府撤回，但原告不同意撤诉的情况下，案件的走向取决于法院的进一步处理以及原告的诉讼策略。原告应仔细评估自己的诉讼基础和诉求，咨询专业律师的意见，并密切关注法院的处理进展以及时应对。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。