学校采购校服将采购款打给第三方是否违纪，需根据具体情况和合同约定来判断，不能一概而论。以下从不同角度进行分析：
合同约定角度：
- 如果学校与校服供应商之间的采购合同中明确约定了采购款的支付方式，包括支付给第三方（如指定的账户、中间商或代理机构等），并且这种支付方式符合合同目的和双方的真实意愿，那么将采购款打给第三方并不构成违纪。
- 相反，如果合同中没有明确约定支付给第三方，或者约定了支付给供应商本身，而学校却擅自将采购款打给第三方，这可能构成违约行为，供应商有权要求学校按照合同约定履行支付义务，并可能追究学校的违约责任。
财务管理与审计角度：
- 从学校财务管理的角度来看，如果学校将采购款打给第三方，需要确保这一行为符合学校的财务管理制度和规定，包括资金使用的审批流程、支付凭证的保存等。
- 同时，这一行为也需要接受审计部门的审计和监督。如果审计发现学校将采购款打给第三方存在违规操作或不当得利的情况，学校及相关责任人可能会面临纪律处分或法律责任。
法律法规角度：
- 在一般情况下，将采购款打给第三方并不直接违反法律法规。但是，如果这一行为涉及贪污、受贿、挪用公款等违法行为，那么相关责任人将面临法律的制裁。
- 例如，如果学校相关人员与第三方串通，通过虚增采购款、伪造支付凭证等手段骗取学校资金，这可能构成贪污或受贿行为，将受到法律的严惩。
法律建议：
- 学校在采购校服时，应确保与供应商签订详细的采购合同，明确约定采购款的支付方式、支付对象等关键条款。
- 学校应建立健全的财务管理制度，确保资金使用的合规性和透明性。对于将采购款打给第三方的行为，应严格按照学校财务管理制度和规定进行审批和操作。
- 学校应接受审计部门的定期审计和监督，确保资金使用的合法性和合规性。对于审计发现的问题，应及时进行整改和处理。
可能的法律后果：
- 如果学校将采购款打给第三方的行为构成违约，供应商有权要求学校按照合同约定履行支付义务，并可能追究学校的违约责任，包括要求学校支付违约金、赔偿损失等。
- 如果这一行为涉及贪污、受贿、挪用公款等违法行为，相关责任人将面临法律的制裁，包括有期徒刑、罚金等刑事处罚。
综上所述，学校采购校服将采购款打给第三方是否违纪，需根据具体情况和合同约定来判断。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。