非法占地纠纷的处理需通过行政处理、行政复议或行政诉讼、民事赔偿等步骤进行，处理过程中需掌握土地权属证明、占地行为证据、损失证据等关键材料。具体分析如下：
一、处理步骤
行政处理阶段
- 投诉举报：向当地国土资源管理部门（现为自然资源主管部门）投诉举报非法占地行为。根据《土地管理法》的相关规定，自然资源主管部门有权对非法占地行为进行调查处理。
- 调查取证：自然资源主管部门在接到投诉举报后，会展开调查，收集相关证据，包括现场勘查、询问当事人等。
- 行政处罚：如果确认存在非法占地行为，自然资源主管部门会依法作出行政处罚决定，如责令退还非法占用的土地、限期拆除在非法占用的土地上新建的建筑物和其他设施、恢复土地原状，以及罚款等。
行政复议或行政诉讼阶段
- 行政复议：如果当事人对自然资源主管部门的行政处罚决定不服，可以依法申请行政复议。行政复议机关会对行政处罚决定的合法性、适当性进行审查，并作出复议决定。
- 行政诉讼：如果当事人对行政复议决定仍不服，或者未选择行政复议而直接选择诉讼，可以依法向人民法院提起行政诉讼。人民法院会对行政处罚决定的合法性进行司法审查，并作出判决。
民事赔偿阶段
- 协商调解：在行政处理过程中或之后，当事人之间可以就非法占地造成的损失进行协商调解，达成赔偿协议。
- 民事诉讼：如果协商调解不成，受损方可以依法向人民法院提起民事诉讼，要求非法占地方赔偿因非法占地行为造成的损失。
二、需掌握的证据
- 土地权属证明：证明自己对土地拥有合法权属的证据，如土地使用权证、土地承包经营权证等。
- 占地行为证据：证明非法占地方存在非法占地行为的证据，如现场照片、视频、证人证言等。这些证据应能清晰展示非法占地的具体位置、范围、时间以及占地方式等。
- 损失证据：证明因非法占地行为造成损失的证据，如损失清单、评估报告、相关费用票据等。这些证据应能详细列出因非法占地行为导致的直接损失和间接损失，以及损失的具体金额和计算方式。
- 行政处罚决定书：如果自然资源主管部门已经对非法占地行为作出了行政处罚决定，该决定书也是重要的证据之一。它证明了非法占地行为的存在以及行政机关对该行为的认定和处理结果。
- 其他相关证据：根据具体情况，还可能需要提供其他相关证据，如规划许可证、建设许可证等，以证明自己的建设行为是否合法，以及非法占地行为是否违反了相关规划或建设规定。