协议款余额是否属于“扣钱”，这主要取决于协议的具体内容以及双方当事人的约定和实际履行情况，不能一概而论。以下从几个角度进行分析：

1. 协议内容明确约定：

   • 如果协议中明确规定了协议款余额的处理方式，比如“协议期满或终止后，未使用的协议款余额将不予退还”或“协议款余额将按照一定比例扣除作为违约金或手续费”等，那么在这种情况下，协议款余额的处理就按照协议中的约定来执行，可以视为一种“扣钱”的行为。

2. 协议内容未明确约定，但双方有实际履行行为：

   • 如果协议中没有明确规定协议款余额的处理方式，但双方在实际履行过程中形成了某种惯例或默契，比如一方在协议期满后主动提出扣除部分余额作为服务费或管理费，而另一方也未提出异议并接受了这一处理方式，那么在这种情况下，也可以视为一种“扣钱”的行为，但这种行为可能缺乏明确的法律依据，容易引发纠纷。

3. 协议内容未明确约定，且双方无实际履行行为：

   • 如果协议中没有明确规定协议款余额的处理方式，且双方在实际履行过程中也未形成任何惯例或默契，那么在这种情况下，协议款余额通常应视为未使用的资金，应当退还给支付方或按照双方协商的方式进行处理。此时，如果一方擅自扣除余额，就可能构成违约或侵权行为。

法律建议：

• 在签订协议时，双方应明确约定协议款余额的处理方式，以避免后续纠纷。
• 如果协议中未明确约定，双方应通过协商、调解等方式解决争议，必要时可以寻求法律途径维护自己的合法权益。
• 如果一方擅自扣除协议款余额，另一方可以要求其提供合法依据，如无法提供，则有权要求其退还扣除的款项，并可能要求其承担违约责任或赔偿责任。

可能后果：

• 如果一方擅自扣除协议款余额且无法提供合法依据，可能面临被另一方起诉要求退还款项并承担违约责任或赔偿责任的风险。
• 如果双方因协议款余额问题产生纠纷且无法协商解决，可能需要通过诉讼或仲裁等法律途径来解决争议，这将耗费双方的时间和精力，并可能产生额外的法律费用。

因此，在处理协议款余额问题时，双方应谨慎对待，确保自己的权益得到充分保障。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。