签订委托还贷协议后，扣款流程通常按照以下方式进行：

首先，需要明确的是，委托还贷协议通常与公积金贷款相关，旨在方便借款人通过公积金账户自动偿还贷款，避免逾期等风险。在签订协议后，每月的还款日，公积金业务系统会根据约定的扣款顺序自动进行划扣。

扣款顺序：

1. 借款人公积金账户：系统首先会从借款人的公积金账户中划扣余额用于偿还当月贷款本息。
2. 配偶或共同借款人公积金账户：如果借款人的公积金账户余额不足，系统会继续从配偶或共同借款人的公积金账户中划扣。
3. 借款人银行卡余额：如果公积金账户余额仍然不足，差额部分将由系统从借款人的银行卡余额中划扣。

扣款方式：

• 公积金账户划扣：这是主要的扣款方式，优先使用公积金账户余额进行偿还。
• 银行卡划扣：当公积金账户余额不足时，系统会自动从绑定的银行卡中划扣差额部分。

注意事项：

1. 确保账户余额充足：为了避免逾期等风险，借款人应确保公积金账户和银行卡账户在还款日前有足够的余额。
2. 关注扣款情况：建议借款人定期查看公积金账户和银行卡账户的扣款情况，确保贷款正常偿还。
3. 异地委托扣划：对于异地缴存与贷款的借款人，需要满足一定条件后才能办理异地委托扣划业务，并签订相关授权书。

综上所述，签订委托还贷协议后，扣款流程是自动化的，主要依据公积金账户余额进行划扣，不足部分会从银行卡余额中补扣。借款人应确保账户余额充足，并关注扣款情况，以确保贷款的正常偿还。