结论：第二年没去上班自动离职是否扣钱，不能一概而论，需根据具体情况判断，包括是否违反公司规章制度、是否给公司造成损失以及劳动合同中的相关约定等。

分析说明：

1. 公司规章制度：

   • 如果公司的规章制度中明确规定了员工自动离职（即未按照正常程序办理离职手续而擅自离职）的处罚措施，包括扣减工资或奖金等，且这些规定不违反法律法规的强制性规定，那么公司有权按照规章制度执行。
   • 法律依据：根据《中华人民共和国劳动合同法》第四条，用人单位应当依法建立和完善劳动规章制度，保障劳动者享有劳动权利、履行劳动义务。用人单位在制定、修改或者决定有关劳动报酬、工作时间、休息休假、劳动安全卫生、保险福利、职工培训、劳动纪律以及劳动定额管理等直接涉及劳动者切身利益的规章制度或者重大事项时，应当经职工代表大会或者全体职工讨论，提出方案和意见，与工会或者职工代表平等协商确定。在规章制度和重大事项决定实施过程中，工会或者职工认为不适当的，有权向用人单位提出，通过协商予以修改完善。用人单位应当将直接涉及劳动者切身利益的规章制度和重大事项决定公示，或者告知劳动者。

2. 给公司造成的损失：

   • 如果员工自动离职给公司造成了经济损失，公司有权要求员工赔偿。在赔偿过程中，公司可能会从员工的工资中扣除相应金额，但扣除的部分不得超过员工当月工资的20%，且扣除后的剩余工资不得低于当地最低工资标准。
   • 法律依据：根据《工资支付暂行规定》第十六条，因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除。但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。

3. 劳动合同约定：

   • 如果劳动合同中明确约定了员工自动离职的违约责任，包括扣减工资或支付违约金等，且这些约定不违反法律法规的强制性规定，那么公司有权按照劳动合同执行。
   • 特别提醒：根据《中华人民共和国劳动合同法》第二十五条，除本法第二十二条和第二十三条规定的情形外，用人单位不得与劳动者约定由劳动者承担违约金。即，除非员工违反了服务期约定或竞业限制约定，否则公司不得要求员工支付违约金。

行动建议：

• 对于员工：在自动离职前，建议先与公司沟通，了解离职手续和可能产生的后果。如果确实需要离职，应按照公司规定办理离职手续，以避免不必要的纠纷。
• 对于公司：在制定规章制度和劳动合同时，应明确规定员工自动离职的处罚措施和赔偿标准，并确保这些规定不违反法律法规的强制性规定。同时，在员工自动离职后，应及时与员工沟通，了解离职原因和可能产生的损失，并按照规定处理。

后续思考依据：

• 在处理类似纠纷时，应首先查阅公司的规章制度和劳动合同，了解双方的权利和义务。
• 如果双方无法协商解决，可以寻求劳动争议调解委员会的帮助或向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。
• 在仲裁或诉讼过程中，应提供充分的证据证明自己的主张，包括公司规章制度、劳动合同、离职手续、损失证明等。