结论：楼上住户加建电梯不通知二楼且设计方案不开通二楼，这一程序是否合法，需结合具体情况判断，但通常情况下，这种做法可能存在程序不合法的问题。以下从不同角度进行分析：

一、从相邻权角度分析

根据《民法典》的相关规定，不动产的相邻权利人应当按照有利生产、方便生活、团结互助、公平合理的原则，正确处理相邻关系。加建电梯属于对共有部分的重大改动，应当充分尊重并保障相邻住户的合法权益，包括但不限于通风、采光、通行等权益。

1. 通知义务：楼上住户在加建电梯前，应当通知二楼住户，并就加建方案进行充分沟通，确保二楼住户的合法权益不受侵害。如果未履行通知义务，可能构成对二楼住户相邻权的侵犯。
2. 设计方案合理性：设计方案不开通二楼，可能直接影响到二楼住户的通行便利。如果这种设计没有合理的理由，且未经过二楼住户的同意，那么该设计方案可能因侵犯相邻权而不被法律所认可。

二、从建筑物区分所有权角度分析

根据《民法典》中关于建筑物区分所有权的规定，业主对建筑物内的住宅、经营性用房等专有部分享有所有权，对专有部分以外的共有部分享有共有和共同管理的权利。加建电梯涉及对共有部分的改动，应当经过业主共同决定，并遵循法定的程序。

1. 业主共同决定：加建电梯需要经过一定比例的业主同意，具体比例可能因地区而异。如果楼上住户在未经过二楼住户同意的情况下擅自加建电梯，可能违反了业主共同决定的原则。
2. 法定程序：加建电梯还需要遵循相关的法定程序，如报批、公示等。如果楼上住户未按照法定程序进行，那么其加建行为可能因程序不合法而面临被叫停或拆除的风险。

三、从实际案例与司法实践角度分析

在实际案例中，法院通常会综合考虑加建电梯的必要性、对相邻住户的影响、是否履行了通知和协商义务等因素来判定加建行为的合法性。如果楼上住户在加建电梯过程中未履行相关义务，且对二楼住户造成了实质性影响，那么法院可能会判定其加建行为不合法。

四、建议与措施

1. 沟通协商：建议楼上住户与二楼住户进行充分沟通，就加建电梯的方案、影响及补偿等问题达成一致意见。
2. 遵循法定程序：在加建电梯前，应确保履行了所有法定程序，如报批、公示等，以确保加建行为的合法性。
3. 寻求法律援助：如果双方无法达成一致意见，建议寻求法律援助或咨询专业律师，以维护自身合法权益。

总结：楼上住户加建电梯不通知二楼且设计方案不开通二楼，这一程序在通常情况下可能存在不合法的问题。为了确保加建行为的合法性并维护相邻住户的合法权益，建议楼上住户在加建电梯前充分履行通知和协商义务，并遵循相关的法定程序。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。