事业单位对人事代理人员违纪的处理，需依据相关法律法规及单位规章制度进行，通常包括以下步骤和要点：

1. 确认违纪事实：

   • 事业单位应首先通过调查、取证等方式，确认人事代理人员是否存在违纪行为，以及违纪的具体事实和情节。这要求单位在处理过程中保持公正、客观，确保事实清楚、证据确凿。

2. 依据规章制度处理：

   • 事业单位应依据本单位制定的规章制度，对违纪人员进行相应的处理。这些规章制度应明确违纪行为的种类、处理程序、处罚措施等，确保处理的合法性和合理性。
   • 若单位规章制度未明确规定或规定与法律法规相冲突，则应依据相关法律法规进行处理，如《事业单位人事管理条例》等。

3. 遵循处理程序：

   • 事业单位在处理违纪人员时，应遵循一定的程序，如通知违纪人员、听取其陈述和申辩、作出处理决定、送达处理决定书等。这些程序旨在保障违纪人员的合法权益，确保处理的公正性和透明度。
   • 特别地，对于涉及解除聘用合同等重大处理决定，事业单位应更加谨慎，确保程序合法、证据充分。

4. 考虑情节轻重与后果：

   • 在处理违纪人员时，事业单位应综合考虑违纪行为的情节轻重、造成的后果以及违纪人员的态度等因素，作出恰当的处理决定。
   • 对于情节轻微、未造成严重后果的违纪行为，可以给予警告、记过等较轻的处罚；对于情节严重、造成重大损失或恶劣影响的违纪行为，则可以给予降低岗位等级、撤职、开除等较重的处罚。

5. 保障申诉权利：

   • 违纪人员对处理决定不服的，有权依法向事业单位或上级主管部门提出申诉。事业单位应建立健全申诉机制，确保违纪人员的申诉权利得到保障。
   • 在处理申诉过程中，事业单位应认真审查申诉理由和证据，依法作出公正的处理决定。

6. 记录与归档：

   • 事业单位应对违纪处理过程进行详细记录，并将相关材料归档保存。这有助于单位在未来的管理中参考和借鉴，也有助于保障违纪人员的合法权益。

在处理过程中，事业单位还需注意以下几点：

• 合法合规：确保处理过程和处理结果均符合相关法律法规和单位规章制度的要求，避免违法违规行为的发生。
• 公正公平：保持公正、公平的态度，不偏袒任何一方，确保处理的公正性和透明度。
• 教育为主：在处理违纪人员时，应注重教育引导，帮助其认识错误、改正错误，促进单位的和谐稳定发展。

如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。