结论：在丈夫因盗窃罪被判刑时，若作案工具小车登记在妻子名下，法院在执行没收时，理论上应当通知妻子，但具体是否通知及通知的方式和时机，可能因案件具体情况和法院执行程序的不同而有所差异。以下从多个角度进行详细分析：
一、法律程序与通知义务
没收程序：根据《中华人民共和国刑法》第六十四条的规定，犯罪分子违法所得的一切财物，应当予以追缴或者责令退赔；对被害人的合法财产，应当及时返还；违禁品和供犯罪所用的本人财物，应当予以没收。没收的财物和罚金，一律上缴国库，不得挪用和自行处理。在此情况下，若小车被认定为供犯罪所用的财物，则可能面临没收。
通知义务：在执行没收程序时，法院通常需要通知相关权利人，以确保其合法权益不受侵害。虽然法律没有明确规定必须通知登记车主（即妻子），但从保护公民财产权的角度出发，法院在执行没收时，应当尽可能通知到相关权利人，以便其提出异议或进行其他法律救济。
二、妻子作为登记车主的权利
财产权保护：妻子作为小车的登记车主，享有对该车辆的财产权。在丈夫因犯罪被没收作案工具时，妻子有权了解没收情况，并可能提出异议或申请法律救济。
异议权：如果妻子认为小车并非供犯罪所用的财物，或者没收行为侵犯了其合法权益，她可以向法院提出异议，并要求法院进行审查。在此情况下，法院应当依法进行审查，并作出相应处理。
三、实际操作中的考虑因素
案件具体情况：法院在执行没收时，会考虑案件的具体情况，包括犯罪的性质、情节、作案工具的作用等。如果小车在犯罪中起到了关键作用，且法院认为有必要没收，那么可能会更加严格地执行没收程序。
法院执行程序：不同地区的法院可能有不同的执行程序和规定。有些法院可能会在执行没收前，通过公告或其他方式通知相关权利人；而有些法院则可能直接执行没收，并在事后通知或允许相关权利人提出异议。
四、建议与措施
了解案件情况：妻子可以主动向法院或律师了解案件的具体情况，包括没收小车的法律依据、程序等。
提出异议或申请法律救济：如果妻子认为没收行为侵犯了其合法权益，她可以向法院提出异议或申请法律救济，如申请复议、提起行政诉讼等。
咨询专业律师：在处理此类法律问题时，妻子可以咨询专业律师，以获取更具体的法律建议和帮助。作为南辉律师，我专注于刑事辩护和拆迁安置领域，能够为你提供专业的法律咨询和辩护服务。
总结：虽然法律没有明确规定在没收作案工具时必须通知登记车主，但从保护公民财产权的角度出发，法院在执行没收时应当尽可能通知到相关权利人。妻子作为小车的登记车主，有权了解没收情况，并可能提出异议或申请法律救济。如有需要，妻子可以咨询专业律师以获取更具体的法律建议和帮助。