结论：在轻伤二级案件中，犯罪嫌疑人已被羁押四十天且已取得被害人谅解的情况下，检察院的处理方式会综合考虑多种因素，包括案件的具体情况、犯罪嫌疑人的认罪态度、社会危害性等，可能作出不起诉决定、提起公诉并提出从宽处理的建议，或者继续审查并补充侦查。
详细分析：
检察院可能作出不起诉决定：
- 法律依据：根据《中华人民共和国刑事诉讼法》的相关规定，对于犯罪情节轻微，依照刑法规定不需要判处刑罚或者免除刑罚的，人民检察院可以作出不起诉决定。在轻伤二级案件中，如果犯罪嫌疑人认罪态度好，积极赔偿被害人损失并取得谅解，且案件社会危害性较小，检察院有可能考虑作出不起诉决定。
- 实践操作：检察院在审查案件时，会综合考虑犯罪嫌疑人的犯罪情节、认罪态度、社会危害性以及被害人意见等因素。如果认为符合不起诉条件，会依法作出不起诉决定，并释放犯罪嫌疑人。
检察院可能提起公诉并提出从宽处理的建议：
- 法律依据：即使检察院决定提起公诉，也可以根据犯罪嫌疑人的认罪态度、赔偿情况等因素，向法院提出从宽处理的建议。这包括建议法院判处缓刑、减轻刑罚等。
- 实践操作：在提起公诉时，检察院会在起诉书中明确提出对犯罪嫌疑人的量刑建议。如果犯罪嫌疑人已取得被害人谅解，且认罪态度好，检察院可能会建议法院从宽处理。
检察院可能继续审查并补充侦查：
- 法律依据：根据《中华人民共和国刑事诉讼法》的规定，人民检察院审查案件时，对于需要补充侦查的，可以退回公安机关补充侦查，也可以自行侦查。
- 实践操作：如果检察院认为案件证据不足或者需要进一步查清事实，可能会决定继续审查并补充侦查。在补充侦查期间，犯罪嫌疑人可能会继续被羁押，但羁押期限会受到法律限制。
建议与注意事项：
- 积极配合检察院工作：犯罪嫌疑人及其家属应积极配合检察院的工作，提供必要的证据和材料，以便检察院全面了解案件情况。
- 关注案件进展：及时关注案件的进展情况，了解检察院的处理意见，以便及时采取应对措施。
- 考虑法律后果：在案件处理过程中，应充分考虑各种可能的法律后果，包括不起诉、缓刑、减轻刑罚等，以便做出合理的决策。
后续行动：
- 如果您或您的家人是案件的犯罪嫌疑人，建议尽快咨询专业律师，了解案件的具体情况和可能的法律后果，以便制定合适的应对策略。
- 如果您对检察院的处理意见有异议，可以在法定期限内提出申诉或申请复议，以维护自己的合法权益。
如有任何法律疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供详细的法律建议。