超限证不按规定路线行驶的处罚主要依据《中华人民共和国公路法》及《公路安全保护条例》的相关规定，具体处罚措施如下：

1. 行政处罚
   根据《公路安全保护条例》第六十五条，车辆未按照超限运输许可的路线行驶的，公路管理机构可责令改正，并处以3万元以下罚款。处罚力度通常结合超限程度、路线偏离距离、是否造成实际损害等因素综合判定。例如：

   • 若仅轻微偏离路线且未造成危害，可能处以较低罚款（如数千元）；
   • 若因偏离路线导致桥梁、道路损坏，罚款可能接近上限，并需承担修复费用。

2. 信用惩戒与后续影响

   • 信用记录：违规行为可能被录入交通运输部门信用信息系统，影响企业或个人信用评级，进而在招投标、运输许可等方面受限。
   • 许可撤销：严重违规时，公路管理机构可撤销超限运输许可，并要求重新申请，增加时间与经济成本。
   • 刑事责任：若因偏离路线引发重大交通事故（如桥梁坍塌、人员伤亡），可能涉嫌“危险物品肇事罪”或“交通肇事罪”，需承担刑事责任。

3. 特殊情形说明

   • 紧急避险：若因自然灾害、事故等不可抗力被迫偏离路线，需及时向公路管理机构报告并提供证明，可免于处罚。
   • 路线变更申请：如需调整路线，应提前向原许可机关申请变更，未经批准擅自变更仍属违规。

建议：运输企业或个人应严格规划路线，确需变更时及时履行审批手续；若已发生违规，需主动配合调查，积极整改以减轻处罚。如有具体案件细节需进一步分析，可直接向我咨询。