有地基证的房屋是否合法，不能一概而论，需结合具体情况判断。以下从不同角度进行分析：
地基证的性质与作用
- 地基证，通常指的是宅基地使用权证或建设用地规划许可证等相关证件，它证明了土地使用者对特定地块享有合法的使用权或建设权。然而，地基证本身并不直接等同于房屋的合法性证明。
- 房屋的合法性，除了土地使用权外，还需考虑建设是否符合规划、是否取得建设工程规划许可证、是否经过竣工验收等多个环节。
合法房屋的构成要件
- 土地使用权合法：房屋必须建在合法取得使用权的土地上，如宅基地、建设用地等。
- 规划许可合规：房屋建设需符合当地的城市规划或乡村规划，并取得相应的建设工程规划许可证。
- 建设过程合规：房屋建设需按照规划许可的要求进行，包括建筑高度、面积、结构等，并经过竣工验收合格。
- 产权登记完备：房屋建成后，需依法进行产权登记，取得房屋所有权证或不动产权证。
仅有地基证的情况分析
- 如果房屋仅持有地基证，而未取得建设工程规划许可证、未经过竣工验收或未进行产权登记，那么该房屋可能存在违法建设或产权不完整的问题。
- 特别是如果房屋建设违反了规划许可的要求，如超面积、超高度建设等，即使持有地基证，也可能面临被认定为违法建筑的风险。
法律建议
- 核实证件：首先核实地基证的真实性和有效性，确认土地使用权是否合法。
- 查询规划：向当地规划部门查询房屋建设是否符合规划要求，是否取得建设工程规划许可证。
- 完善手续：如果房屋建设存在违规情况，应尽快与相关部门沟通，了解补办手续或整改的要求，以完善房屋的合法性。
- 产权登记：在房屋建设合规且经过竣工验收后，及时办理产权登记手续，确保房屋产权的完整性和合法性。
可能面临的法律后果：
- 如果房屋被认定为违法建筑，可能面临被责令拆除、罚款等行政处罚。
- 在房屋交易、继承等过程中，违法建筑可能无法办理相关手续，影响权益的实现。
总结：有地基证的房屋并不一定合法，其合法性需结合土地使用权、规划许可、建设过程和产权登记等多个方面进行综合判断。如果您对房屋的合法性有疑问，或需要进一步了解相关法律手续，请直接向我咨询。