当公司超过认缴出资日期时，行政审批局（或公司登记机关）会根据相关法律法规和政策要求进行处理。以下是对此问题的详细解答：

一、政策背景与要求

根据《中华人民共和国公司法》、《公司登记管理实施办法》以及国务院关于实施注册资本登记管理制度的规定，对于2024年6月30日前登记设立的公司，如果其认缴注册资本尚未实缴到位，且剩余认缴出资期限自2027年7月1日起超过5年的，公司需要在2027年6月30日前将其剩余认缴出资期限调整至5年内，并将这一调整记载于公司章程。股东则需要在调整后的认缴出资期限内足额缴纳认缴的出资额。对于股份有限公司，发起人需要在2027年6月30日前按照其认购的股份全额缴纳股款。

二、特殊豁免情况

对于承担国家重大战略任务、关系国计民生或涉及国家安全、重大公共利益的公司，如果国务院有关主管部门或者省级人民政府提出意见，并经国务院市场监督管理部门同意，这些公司可以按原出资期限出资。但此类公司需要及时将相关批准文件报送登记机关备案。

三、行政审批局的处理流程

1. 公司准备：

   • 公司需要召开股东会，就调整注册资本出资期限、出资额等事项进行决议，并形成书面决议文件。
   • 修订公司章程，明确调整后的出资期限、出资额等相关内容，并遵循法定程序进行修订。
   • 准备公司备案申请书、股东会决议、修订后的公司章程等申请材料，确保材料真实、准确、完整。

2. 提交申请：

   • 公司可以通过政务服务网提交申请，也可以前往行政审批局现场提交申请材料。
   • 申请时需要准确填写公司基本信息、调整后的出资期限、出资额等关键信息，并上传或提交相关申请材料的电子或纸质文档。

3. 审核办理：

   • 行政审批局收到申请后，会对申请材料进行形式审查。如果材料齐全、符合法定形式，会予以受理；如果材料不齐全或不符合法定形式，会当场一次性告知公司需补正的内容。
   • 行政审批局完成审核后，对符合调整要求的公司，会依法办理注册资本出资期限、出资额的变更登记手续，并换发营业执照（如果涉及注册资本出资额变更）。对不符合要求的公司，会作出不予登记决定并说明理由。

4. 信息公示：

   • 公司需要将调整注册资本出资期限、出资额等相关信息通过国家企业信用信息公示系统向社会公示。公示信息包括股东认缴和实缴的出资额、出资方式、出资期限，发起人认购的股份数等，并确保公示信息真实、准确、完整。

四、未按时调整的后果

如果公司未按照上述规定调整出资期限、注册资本，行政审批局会责令公司改正。如果逾期未改正，行政审批局会在国家企业信用信息公示系统作出特别标注并向社会公示。此外，公司的股东或者发起人如果未按照规定缴纳认缴的出资额或者股款，或者公司未依法公示有关信息，还会依照公司法、《企业信息公示暂行条例》的有关规定予以处罚。

综上所述，当公司超过认缴出资日期时，应及时按照相关法律法规和政策要求进行调整，并遵循行政审批局的处理流程进行办理，以避免不必要的法律风险和处罚。