诉讼、仲裁、人民调解代理合同纠纷，其案由主要取决于合同的具体内容以及纠纷的性质，但通常这类纠纷可以归类为“委托合同纠纷”或根据具体代理事项确定更具体的案由。以下是对这一问题的详细分析：
诉讼代理合同纠纷：
- 当合同涉及的是代理当事人进行诉讼活动时，如代理起诉、应诉、上诉等，这类纠纷通常与诉讼程序紧密相关。
- 在法律上，这类合同往往被视为委托合同的一种，即当事人委托律师或其他法律专业人士代为处理诉讼事务。
- 若纠纷主要围绕诉讼代理行为的合法性、有效性或代理费用的支付等展开，则案由可确定为“诉讼代理合同纠纷”，在更广泛的分类下，它可能归属于“委托合同纠纷”的范畴。
仲裁代理合同纠纷：
- 仲裁代理合同涉及的是代理当事人进行仲裁活动，如提交仲裁申请、参与仲裁庭审、接受仲裁裁决等。
- 与诉讼代理类似，仲裁代理合同也属于委托合同的一种，只是其处理的是仲裁事务而非诉讼事务。
- 若纠纷围绕仲裁代理行为产生，如代理权限的争议、仲裁费用的支付等，则案由可确定为“仲裁代理合同纠纷”，同样可能归属于“委托合同纠纷”。
人民调解代理合同纠纷：
- 人民调解代理合同涉及的是代理当事人参与人民调解活动，这是一种非诉讼的纠纷解决方式。
- 在这类合同中，代理人可能协助当事人准备调解材料、参与调解过程、接受调解结果等。
- 若纠纷围绕人民调解代理行为产生，如调解协议的效力、代理费用的支付等，虽然直接案由可能不常见“人民调解代理合同纠纷”这一表述，但根据合同性质和纠纷内容，它同样可以归属于委托合同纠纷的范畴，或者根据具体调解事项确定更具体的案由。
综合建议：
- 在处理这类纠纷时，首先应仔细审查合同内容，明确代理的具体事项、权限、费用等关键条款。
- 根据纠纷的具体性质，如涉及诉讼、仲裁还是人民调解，以及纠纷的具体内容，如代理行为的合法性、有效性、费用支付等，来确定更具体的案由。
- 若合同中有明确约定纠纷解决方式（如仲裁或诉讼），则应遵循合同约定进行；若合同未约定或约定不明，则可根据相关法律法规和司法实践来确定最合适的纠纷解决方式。
后续行动建议：
- 若您正面临此类纠纷，建议收集并整理好所有相关证据材料，包括合同文本、代理行为记录、费用支付凭证等。
- 咨询专业律师（如我，梁升律师，专注于婚姻家庭、合同纠纷领域），以获取更具体、更专业的法律建议和帮助。
- 根据律师的建议和纠纷的具体情况，选择合适的纠纷解决方式，如协商、调解、仲裁或诉讼等。