合作合同纠纷在法律上通常归属于合同纠纷这一大类，而具体的案由则需根据合作合同的类型、纠纷性质及法律规定来确定。以下是对此问题的详细解答：
一、合作合同纠纷的基本属性
合作合同，作为平等主体的自然人、法人或其他组织之间设立、变更、终止民事权利义务关系的协议，其纠纷本质上属于合同纠纷。这类纠纷主要围绕合同的签订、解释、履行、变更、解除以及违约责任等方面产生，涉及的是平等民事主体之间的财产关系问题。
二、合作合同纠纷的具体案由
合作合同纠纷的具体案由，需根据合作合同的具体类型和纠纷性质来判断。以下是一些常见的合作合同纠纷案由：
合伙合同纠纷：
- 当合作合同涉及两个或两个以上的合伙人共同出资、经营、共享收益、共担风险时，若发生纠纷，则可能构成合伙合同纠纷。
联营合同纠纷：
- 若合作合同是联营合同，即企业之间或者企业、事业单位之间联营，共同经营、不具备企业法人的条件，或者虽具备企业法人的条件，但未被核准登记为法人而以联营名义从事经营活动时发生的纠纷，则可能构成联营合同纠纷。不过，随着法律的发展，联营合同这一概念已逐渐被其他合作形式所取代，但在某些特定情境下仍可能涉及。
其他无名合作合同纠纷：
- 对于无法归入上述特定类别的合作合同纠纷，如新型合作模式、特定行业合作等产生的纠纷，可能构成无名合作合同纠纷。这类纠纷的案由确定需结合合同的具体内容、双方的权利义务以及纠纷的性质来综合判断。
三、确定案由的依据
在确定合作合同纠纷的具体案由时，主要依据以下三个方面：
合同类型：
- 根据合作合同的名称及实际内容，判断其属于哪种类型的合同，如合伙合同、联营合同等。
法律规定：
- 依据《中华人民共和国民法典》及相关司法解释中关于合同纠纷的规定，确定案由的法律依据。
争议焦点：
- 结合双方诉辩主张及核心矛盾，确定纠纷的焦点所在，从而进一步确定案由。
四、法律建议
仔细审查合同条款：
- 在签订合作合同时，应仔细审查合同条款，特别是关于争议解决的条款，明确双方的权利义务以及纠纷解决方式，以减少后续纠纷的发生。
及时咨询专业律师：
- 若发生合作合同纠纷，建议及时咨询专业律师，了解自身的法律权益和可能的法律后果，以便制定合理的维权策略。
选择合适的纠纷解决方式：
- 根据纠纷的性质和实际情况，选择合适的纠纷解决方式，如协商、仲裁或诉讼等。协商是解决纠纷最便捷、成本最低的方式；若协商不成，且合同中约定了仲裁条款，则可以根据该条款向相应的仲裁机构申请仲裁；若没有仲裁条款或仲裁不成，则可以向人民法院提起诉讼。
如有任何关于合作合同纠纷的法律问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。我将根据你的具体情况，提供专业、全面的法律服务。