驾驶外埠机动车违反进京通行禁令标志，一天内通常只会被处罚一次，但具体还需根据违规情形及是否及时驶离等因素综合判断。以下是对此问题的详细分析：
一、一般情形下的处罚
处罚依据：
- 根据《中华人民共和国道路交通安全法》第三十八条，车辆、行人应当按照交通信号通行，禁令标志属于交通信号的一种。
- 根据《中华人民共和国道路交通安全法》第九十条，机动车驾驶人违反道路交通安全法律、法规关于道路通行规定的，处警告或者二十元以上二百元以下罚款。在北京市，对于驾驶外埠机动车违反进京通行禁令标志的违法行为，通常会对驾驶人处以100元罚款，并记3分。
一天内的处罚次数：
- 在一般情况下，如果驾驶外埠机动车在一天内多次违反进京通行禁令标志，但每次违规行为之间没有明显的间隔（如未驶离违规区域又再次违规），且被同一交通监控设备或交警查获，通常会被视为一次违法行为进行处罚。
- 然而，如果驾驶人在违规后及时驶离违规区域，并在之后再次违规，那么每次违规都可能被视为独立的违法行为，从而面临多次处罚。但这种情况在实际操作中较为少见，因为交通管理部门通常会考虑违规行为的连续性和合理性。
二、特殊情形下的处罚
未办理进京通行证件：
- 如果外埠机动车未办理进京通行证件就进入需要办理进京证才能通行的区域，处100元罚款并记3分。4小时内不会重复罚款，但超过4小时未驶离，会重新抓拍并再次处以100元罚款，记3分。
已办理进京通行证件但违规行驶：
- 如果驾驶人已办理进京通行证件，但违反通行证的时间、范围和路线等规定行驶，同样会被视为违反禁令标志指示的违法行为，并面临相应的处罚。例如，载客汽车在工作日7时至9时、17时至20时在五环路（含）以内道路行驶，或在大兴区部分道路行驶，处100元罚款并记3分。
三、应对建议
了解并遵守规定：
- 驾驶外埠机动车在京行驶时，务必提前了解并遵守北京的交通管理规定，包括办理进京通行证、遵守通行证的时间、范围和路线等规定。
及时处理违法通知：
- 如果收到违法通知，驾驶人应首先查看相关的违法记录照片或视频，确认违法事实。若对违法认定有异议，应在规定时间内携带行驶证、驾驶证等证件，前往当地交通管理部门的违法处理窗口进行陈述和申辩。
准备相关证据：
- 在陈述和申辩时，驾驶人可以准备好相关证据材料（如行车记录仪视频、相关时间地点的证明等），以支持自己的观点，并请求交通管理部门核实与酌情处理。
总结来说，驾驶外埠机动车违反进京通行禁令标志一天内通常只会被处罚一次，但具体还需根据违规情形及是否及时驶离等因素综合判断。为了避免不必要的处罚和麻烦，建议驾驶人提前了解并遵守相关规定。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。