小车违反进京通行禁令标志指示行驶，是会被扣分的，同时还会面临罚款。具体来说：

一、法律依据

根据《中华人民共和国道路交通安全法》第三十八条，车辆、行人应当按照交通信号通行。禁令标志属于交通信号的一种，因此，违反禁令标志指示行驶即违反了该规定。同时，根据《中华人民共和国道路交通安全法》第九十条，机动车驾驶人违反道路交通安全法律、法规关于道路通行规定的，将处警告或者二十元以上二百元以下罚款。具体到违反进京通行禁令标志的情况，处罚措施通常更为明确。

二、处罚措施

1. 一般情形：

   • 对于驾驶外埠机动车违反进京通行禁令标志的违法行为，通常会对驾驶人处以100元罚款，并记3分。这是最常见的处罚情况。

2. 未办理进京通行证件：

   • 如果外省、区、市机动车进入需要办理进京证才能通行的区域，且未办理或通行证过期，将被处以100元罚款并记3分。4小时内不会重复罚款，但超过4小时未驶离，会重新抓拍并再次处以100元罚款，记3分。

3. 已办理进京通行证件但违规行驶：

   • 载客汽车在工作日7时至9时、17时至20时在五环路（含）以内道路行驶，或在大兴区部分道路行驶，处100元罚款并记3分。
   • 载货汽车在6时至24时在六环路（含）以内道路行驶，同样处100元罚款并记3分。

三、特殊情况及应对建议

• 特殊情况：若因不可抗力因素（如导航错误且及时采取合理补救措施、突发紧急事件等）导致违反禁令标志，在有充分证据证明的情况下，可以向交通管理部门提出申诉，说明情况，请求核实与酌情处理。
• 应对建议：
  • 收到违法通知后，驾驶人应首先查看相关的违法记录照片或视频，确认违法事实。
  • 若对违法认定有异议，应在规定时间内携带行驶证、驾驶证等证件，前往当地交通管理部门的违法处理窗口进行陈述和申辩。
  • 准备好相关证据材料（如行车记录仪视频、相关时间地点的证明等），以支持自己的观点。

四、综合分析与指导

驾驶小车在京行驶时，务必严格遵守交通规则和禁令标志，以避免不必要的处罚。如果对进京通行政策或相关交通法规有疑问，可以直接向我咨询，我会为你提供详细的法律解答。通过了解并遵守相关法律法规，我们可以共同维护良好的交通秩序和安全环境。