结论：在对方归还诈骗款项后，能否撤销案件取决于案件所处的阶段以及相关法律规定，不能一概而论。以下从不同情况为你详细分析：
案件尚未正式立案
- 公安机关未立案处理：如果公安机关只是受理了你的报案，但尚未正式立案，此时对方归还了诈骗款项，你可以向公安机关说明情况，并请求不再立案。公安机关在审查后，如果认为情节显著轻微、危害不大，不认为是犯罪的，可能会作出不立案的决定。这种情况下，案件实际上就不会进入刑事诉讼程序，相当于“撤销”了案件。
- 公安机关已决定立案但尚未采取强制措施：即便公安机关已经决定立案，但在尚未对嫌疑人采取刑事拘留、逮捕等强制措施前，对方归还了诈骗款项，你仍可以向公安机关提出撤销案件的请求。公安机关会综合考虑案件的性质、情节以及社会危害程度等因素，决定是否撤销案件。如果公安机关认为符合撤销案件的条件，会依法作出撤销案件的决定。
案件已正式立案并进入刑事诉讼程序
- 公安机关已立案并采取强制措施：如果案件已经正式立案，并且公安机关已经对嫌疑人采取了刑事拘留、逮捕等强制措施，此时对方归还诈骗款项，虽然可以作为量刑情节考虑，但并不能直接导致案件的撤销。因为案件已经进入了刑事诉讼程序，需要由检察机关审查起诉，并由法院进行审判。在这种情况下，你可以向检察机关或法院说明对方已经归还诈骗款项的情况，请求从轻或减轻处罚。
- 检察机关已提起公诉：如果案件已经进入审判阶段，检察机关已经向法院提起了公诉，此时对方归还诈骗款项，同样不能直接导致案件的撤销。但你可以在法庭审理过程中，向法庭说明对方已经归还诈骗款项的情况，并请求法庭从轻或减轻处罚。法庭在审理案件时，会综合考虑案件的性质、情节以及被告人的认罪态度、退赔情况等因素，作出公正的判决。
法律建议
- 及时与公安机关沟通：在对方归还诈骗款项后，你应及时与公安机关取得联系，说明情况，并请求公安机关根据案件实际情况作出相应处理。
- 保留相关证据：无论案件是否撤销，你都应保留好与诈骗案件相关的所有证据，包括转账记录、聊天记录、报案回执等，以备不时之需。
- 关注案件进展：如果案件已经进入刑事诉讼程序，你应密切关注案件的进展情况，及时了解检察机关和法院的处理意见，并根据需要提供必要的协助和配合。
最后，每个案件的具体情况都有所不同，能否撤销案件还需根据案件的实际情况以及相关法律规定进行综合判断。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。