该流程是否合法不能一概而论，需分情况讨论：

1. 若贷款资金本就应通过国库进行划转与监管，则流程合法
   在农村贫困户贷款政策中，部分专项贷款资金会通过国库进行统一划转与监管，以确保资金专款专用、防止挪用。例如，扶贫贴息贷款的资金发放可能涉及财政部门与金融机构的协同操作，资金先进入国库账户，再按程序拨付至贫困户账户或指定用途账户。这种情况下，流程符合《财政专项扶贫资金管理办法》等政策要求，合法合规。

2. 若贷款资金本应直接发放至贫困户账户，却绕过正常流程进入国库，则可能涉嫌违规
   根据《贷款通则》及扶贫贷款相关政策，贷款资金原则上应直接发放至借款人账户（贫困户），或按合同约定用途支付至第三方账户。若资金未遵循这一路径，而是被截留至县里国库，且无合法依据（如政策明确规定的监管程序），则可能涉嫌违规操作，例如：

   • 违反贷款资金发放的直接性原则，损害贫困户权益；
     
   • 若国库截留资金用于其他用途，可能涉及挪用专项资金，违反《财政违法行为处罚处分条例》等法规。

建议行动：

• 核实贷款合同条款，确认资金发放路径是否与合同约定一致；
  
• 查询当地扶贫贷款政策文件，明确资金监管的具体流程；
  
• 若发现违规，可向当地财政部门、银保监分局或纪检监察机关举报。
  

如有进一步细节（如贷款类型、政策依据等），可提供更多信息以便更精准分析。