检察院作出不起诉决定后，公安机关一般应当撤案，但并非绝对，需根据案件实际情况和检察院的意见进行进一步处理。以下是对此问题的详细分析：
一、法定不起诉情形下的处理
适用条件：
- 当犯罪嫌疑人没有犯罪事实，或符合《刑事诉讼法》第十六条规定的情形时（如情节显著轻微、危害不大，不认为是犯罪的；犯罪已过追诉时效期限的；经特赦令免除刑罚的等），检察院应作出法定不起诉决定。
法律后果：
- 在此类情形下，公安机关在收到检察院的不起诉决定书后，应当对案件进行撤案处理，同时解除对犯罪嫌疑人所采取的相关强制措施，如拘留、逮捕等，使案件得以终结。
二、酌定不起诉与证据不足不起诉的处理差异
酌定不起诉：
- 适用条件：犯罪情节轻微且依照刑法规定不需要判处刑罚或免除刑罚的情形。
- 法律后果：公安机关通常不会主动撤案，但可根据检察院建议对涉案财物解除查封、扣押、冻结。若后续发现新证据，可重新移送审查起诉。
证据不足不起诉：
- 适用条件：经补充侦查后仍证据不足，不符合起诉条件的情形。
- 法律后果：公安机关可依据《人民检察院刑事诉讼规则》要求复议复核。若检察院维持不起诉决定，公安机关应当撤销案件；若发现新证据，可重新启动侦查程序。
三、特殊情形下的处理原则
存疑不诉后的新证据：
- 公安机关在撤案后获取新证据的，可重新立案侦查并移送审查起诉。这体现了刑事诉讼的灵活性和对案件真相的追求。
行政违法与刑事犯罪的衔接：
- 不起诉案件中涉及行政违法的，公安机关应依法给予治安管理处罚或其他行政处罚。这确保了法律程序的完整性和对违法行为的全面追究。
四、被害人的司法救济途径
- 即使检察院作出了不起诉决定，并且公安机关已经撤案，被害人仍然有可能通过司法途径寻求救济。如果被害人不服检察院的不起诉决定，他们可以直接向人民法院提起诉讼。在被害人死亡或丧失行为能力的情况下，其法定代理人或近亲属也有权向人民法院起诉。人民法院受理案件后，人民检察院需将相关案件材料移送至人民法院，以便进行进一步的审理和判决。
五、法律依据
- 《中华人民共和国刑事诉讼法》第十六条：有下列情形之一的，不追究刑事责任，已经追究的，应当撤销案件，或者不起诉，或者终止审理，或者宣告无罪：（一）情节显著轻微、危害不大，不认为是犯罪的；（二）犯罪已过追诉时效期限的；（三）经特赦令免除刑罚的；（四）依照刑法告诉才处理的犯罪，没有告诉或者撤回告诉的；（五）犯罪嫌疑人、被告人死亡的；（六）其他法律规定免予追究刑事责任的。
- 《公安机关办理刑事案件程序规定（2020年修订本）》第一百八十六条：经过侦查，发现具有下列情形之一的，应当撤销案件：（一）没有犯罪事实的；（二）情节显著轻微、危害不大，不认为是犯罪的；（三）犯罪已过追诉时效期限的；（四）经特赦令免除刑罚的；（五）犯罪嫌疑人死亡的；（六）其他依法不追究刑事责任的。
综上所述，检察院作出不起诉决定后，公安机关的处理方式并非一成不变，而是需根据案件的实际情况和检察院的意见来做出决定。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。